More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0136 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0136  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 456 aa  923    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0336  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  39.5 
 
 		 453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  38.34 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  38.58 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  38.58 
 
 		 454 aa  332  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  37.04 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  39.86 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  38.94 
 
 		 457 aa  325  8.000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  36.5 
 
 		 457 aa  325  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  38.72 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  38.34 
 
 		 455 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  37.78 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  37.72 
 
 		 454 aa  323  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  38.28 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  36.4 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  37.56 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  37.56 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  37.56 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  37.56 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  36.26 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  36.18 
 
 		 453 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  37.12 
 
 		 470 aa  319  5e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  37.56 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  37.33 
 
 		 458 aa  319  7e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  38.34 
 
 		 446 aa  318  9e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  39.82 
 
 		 450 aa  318  9e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  36.8 
 
 		 459 aa  318  9e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  37.33 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  37.33 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  37.12 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  36.73 
 
 		 458 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  38.6 
 
 		 457 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  35.81 
 
 		 455 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  36.54 
 
 		 453 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  35.81 
 
 		 455 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  36.46 
 
 		 453 aa  315  8e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  39.91 
 
 		 449 aa  315  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  36.87 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  35.71 
 
 		 461 aa  315  9e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  35.59 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  35.15 
 
 		 457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  36.59 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  35.09 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  39.68 
 
 		 453 aa  312  6.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  35.03 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  36.68 
 
 		 454 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  36.97 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  37.97 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  34.5 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  38.44 
 
 		 455 aa  310  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  35.38 
 
 		 453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  38.13 
 
 		 452 aa  309  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  37.42 
 
 		 489 aa  309  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  36.5 
 
 		 464 aa  309  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  35.38 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  37.17 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  34.23 
 
 		 462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  35.36 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  38.24 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  34.57 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  34.2 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  38.48 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  35.03 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  34.2 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  34.2 
 
 		 456 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  37.11 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  37.28 
 
 		 456 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  36.78 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  35.87 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  37.04 
 
 		 458 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  38.88 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0225  DNA repair protein RadA  36.04 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  35.51 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  35.71 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  36.82 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  37.17 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  36.56 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  37.36 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8361  DNA repair protein RadA  36.81 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  36.84 
 
 		 455 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1332  DNA repair protein RadA  36.9 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.909582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0667  DNA repair protein RadA  35.73 
 
 		 461 aa  303  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  38.43 
 
 		 448 aa  303  6.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  36.81 
 
 		 457 aa  302  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0695  DNA repair protein RadA  36.46 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  37.04 
 
 		 454 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  36.02 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4937  DNA repair protein RadA  34.9 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4903  DNA repair protein RadA  34.9 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  34.9 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  34.9 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  38.15 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  37.89 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0293  DNA repair protein RadA  34.08 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  35.37 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  35.53 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  35.37 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>