More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0024 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0024  replicative DNA helicase  100 
 
 		 479 aa  977    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  46.36 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  46.56 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11520  primary replicative DNA helicase  45.76 
 
 		 473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.213802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  38.95 
 
 		 460 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  38.86 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  39.13 
 
 		 446 aa  316  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  41.14 
 
 		 449 aa  315  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  38.95 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  39.04 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  37.67 
 
 		 454 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  38.72 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  36.77 
 
 		 443 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  38.99 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  38.44 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  39.36 
 
 		 445 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  39.73 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  38.58 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  39.59 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  37.59 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  39.09 
 
 		 457 aa  309  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  37.3 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  40.32 
 
 		 440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  38.1 
 
 		 481 aa  306  8.000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  37.87 
 
 		 455 aa  305  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  38.79 
 
 		 473 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  39.23 
 
 		 462 aa  305  9.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  39.78 
 
 		 451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  39.78 
 
 		 451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  38.86 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  37.3 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  38.67 
 
 		 448 aa  302  8.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  37.95 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  38.91 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  37.64 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  37.2 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  37.95 
 
 		 444 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  36.74 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  37.27 
 
 		 508 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  37.44 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  37.58 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  36.48 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  36.81 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  38.34 
 
 		 509 aa  296  4e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  37.1 
 
 		 469 aa  296  8e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  37.44 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  38.04 
 
 		 446 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  37.17 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  36.53 
 
 		 461 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  38.01 
 
 		 474 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  36.59 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  36.64 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  35.45 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  36.85 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  37.45 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  38.3 
 
 		 470 aa  289  6e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  35.29 
 
 		 459 aa  290  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  37.75 
 
 		 472 aa  289  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  37.75 
 
 		 472 aa  289  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  37.64 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  37.36 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  38.55 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  34.91 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  35.56 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  38.04 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  35.79 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  37.5 
 
 		 449 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5914  replicative DNA helicase  35.63 
 
 		 453 aa  286  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  34.73 
 
 		 529 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  37 
 
 		 469 aa  286  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  37.36 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  36.51 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  34.99 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  35.23 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  36.7 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  35.79 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  36.69 
 
 		 445 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  35.68 
 
 		 507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  36.08 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  36.38 
 
 		 453 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  36.77 
 
 		 472 aa  282  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  37.08 
 
 		 446 aa  282  9e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  35.87 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  36.22 
 
 		 457 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  36.22 
 
 		 457 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  36.07 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  36.02 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  36.24 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  37.25 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  36.02 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  37.16 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  36.61 
 
 		 442 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  36.22 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  36.38 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  36.22 
 
 		 463 aa  279  6e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  36.59 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  34.4 
 
 		 481 aa  279  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  35.03 
 
 		 472 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>