40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0693 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  464  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  31.28 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  32.09 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  28 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  31.8 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  29.44 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  29.33 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  30.85 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  28.96 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  32.89 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  30.85 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  28.97 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  33.01 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  33.01 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  31.02 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  28.32 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  29.46 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  28.32 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  27.56 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  26.64 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  30.88 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  27.31 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  27.31 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  28.63 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  28.63 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  25.88 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  28.89 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  26.34 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  27.03 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  24.77 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  28 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  26.32 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  28.7 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.75 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  25.5 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  27.32 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  27.85 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  24.12 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  24.72 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>