More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6754 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
517 aa  1025    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4024  AMP-dependent synthetase and ligase  60.94 
 
 
530 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  60.62 
 
 
549 aa  615  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  59.51 
 
 
533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0992  AMP-dependent synthetase and ligase  60.86 
 
 
535 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4250  AMP-dependent synthetase and ligase  60 
 
 
542 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1879  AMP-dependent synthetase and ligase  60.11 
 
 
535 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  60.11 
 
 
535 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.41558 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1925  AMP-dependent synthetase and ligase  60.11 
 
 
535 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0636684  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  54.83 
 
 
525 aa  524  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  54.19 
 
 
519 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  51.93 
 
 
516 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  50.29 
 
 
522 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 
517 aa  362  9e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05990  phenylacetyl-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10160)  40.29 
 
 
562 aa  353  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.255662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  40.74 
 
 
539 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9896  coumaryl-coa ligase  41.06 
 
 
523 aa  336  5.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09216  conserved hypothetical protein  37.73 
 
 
567 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945488  normal  0.813048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
559 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01570  AMP binding protein, putative  38.55 
 
 
577 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
591 aa  319  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00649  4-coumarate-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13110)  40.28 
 
 
560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
564 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
577 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 
563 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
566 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 
590 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 
563 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 
582 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 
561 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 
536 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 
561 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
561 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 
561 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 
561 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 
551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 
561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 
569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 
573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
583 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3122  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 
573 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
565 aa  300  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
578 aa  299  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.09 
 
 
514 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
577 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00398  phenylacetyl-CoA ligase, putative (JCVI)  35.88 
 
 
569 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.7 
 
 
585 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
549 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 
549 aa  297  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 
558 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
577 aa  294  3e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10657  conserved hypothetical protein  35.19 
 
 
550 aa  293  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00945329  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 
579 aa  293  7e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11034  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 
536 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.734558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
521 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.53 
 
 
512 aa  286  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
560 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.93 
 
 
568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.61 
 
 
562 aa  282  9e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 
565 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
584 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
544 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
508 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.35 
 
 
565 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.35 
 
 
565 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
577 aa  277  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
571 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.3 
 
 
564 aa  277  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
510 aa  276  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 
536 aa  276  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.35 
 
 
565 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 
585 aa  276  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
510 aa  276  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 
565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 
583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 
510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 
510 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 
506 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
584 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 
510 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 
512 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
510 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
564 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 
562 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.95 
 
 
510 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.95 
 
 
510 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.95 
 
 
510 aa  273  6e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.74 
 
 
510 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 
513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 
543 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
527 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
554 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
492 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
518 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>