More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01570 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN01570  AMP binding protein, putative  100 
 
 
577 aa  1194    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
533 aa  342  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 
525 aa  332  9e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09216  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 
567 aa  330  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945488  normal  0.813048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 
522 aa  329  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05990  phenylacetyl-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10160)  36.78 
 
 
562 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.255662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 
517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4250  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
542 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07631  phenylacetyl-CoA ligase (AFU_orthologue; AFUA_5G07410)  36.83 
 
 
561 aa  314  2.9999999999999996e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.536816  normal  0.659946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1879  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
535 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1925  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
535 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0636684  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.41558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0992  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
535 aa  303  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4024  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
530 aa  296  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
516 aa  283  6.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  35.6 
 
 
519 aa  281  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10657  conserved hypothetical protein  34.2 
 
 
550 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00945329  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00649  4-coumarate-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13110)  35.31 
 
 
560 aa  266  7e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11034  conserved hypothetical protein  33.79 
 
 
536 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.734558 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00398  phenylacetyl-CoA ligase, putative (JCVI)  31.52 
 
 
569 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09081  conserved hypothetical protein  33.92 
 
 
550 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
536 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 
561 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
514 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10074  conserved hypothetical protein  37.58 
 
 
554 aa  249  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.45987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
561 aa  248  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
561 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
582 aa  246  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
577 aa  246  8e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
561 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
563 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
563 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
563 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
582 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02674  AMP-binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14270)  32.33 
 
 
554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.62 
 
 
561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 
512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
521 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.24 
 
 
510 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
499 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
500 aa  236  9e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
561 aa  236  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
579 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.14 
 
 
510 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
577 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 
551 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
569 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
577 aa  233  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 
585 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 
512 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 
525 aa  230  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 
532 aa  229  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
591 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
508 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 
517 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9896  coumaryl-coa ligase  32.26 
 
 
523 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
553 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.51 
 
 
513 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
583 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
584 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
506 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
559 aa  223  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 
519 aa  223  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
590 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
511 aa  223  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.74 
 
 
516 aa  223  8e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 
564 aa  223  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 
577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 
585 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 
526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 
577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
506 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.54 
 
 
554 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 
539 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
511 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 
507 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
518 aa  220  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 
556 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 
556 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.85 
 
 
556 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.23 
 
 
570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
501 aa  217  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>