50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5347 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 596 aa  1171    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  27.26 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  27.62 
 
 		 605 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  30.97 
 
 		 636 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  30.1 
 
 		 677 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  28.92 
 
 		 583 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  27.94 
 
 		 688 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  27.81 
 
 		 685 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  27.81 
 
 		 685 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  25.98 
 
 		 594 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  25.86 
 
 		 618 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  28.78 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 		 640 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  26.33 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  26.51 
 
 		 394 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  41.26 
 
 		 224 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 		 814 aa  108  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  24.9 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 615 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 		 587 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  30.79 
 
 		 368 aa  97.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 		 515 aa  95.1  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 		 596 aa  91.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  28.73 
 
 		 655 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  26.31 
 
 		 587 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 		 576 aa  88.6  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 		 583 aa  87.4  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  23.64 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  25.05 
 
 		 647 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  25.88 
 
 		 584 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.47 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  25.06 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  23.44 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  23.2 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 		 564 aa  77  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  24.64 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  25.18 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.86 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 		 547 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  25.63 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  28.08 
 
 		 355 aa  51.6  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4001  hypothetical protein  31.39 
 
 		 399 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000201324  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  24.63 
 
 		 593 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 808 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  25.81 
 
 		 414 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>