179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4428 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  33.54 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  36.33 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  31.25 
 
 		 364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  33.02 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  29.81 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  32.69 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  32.27 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  32.27 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  32.9 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  29.82 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  32.27 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  32.24 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  28.62 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  30.23 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  27.22 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  30.03 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  32.8 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  31.17 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  31.94 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  27.69 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  30.77 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  32.67 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  23.73 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  30.32 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  27.95 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  27.95 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  24.35 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  31.61 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4954  NmrA-like  33.73 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3206  NmrA family protein  33.73 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  23.25 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  23.25 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  25.08 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  32.56 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  30.36 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  28.43 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  27.99 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  24.33 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  28.35 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  25.75 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  40.74 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06780  expressed protein  22.41 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03949  NAD(P)H steroid dehydrogenase  36.36 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.53 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  35.38 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.68 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.52 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  35.71 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  35.38 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.92 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.92 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  43.81 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  22.61 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  28.46 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  37.38 
 
 		 280 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  39.81 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.03 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  38.81 
 
 		 280 aa  52.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.55 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  33.33 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.93 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  40.71 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.75 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.96 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.48 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  29.76 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.6 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  35.09 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  38.89 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0164  NmrA family protein  28.74 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0344706  decreased coverage  0.00561101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  36.61 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  33.33 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  37.61 
 
 		 293 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  34.78 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.11 
 
 		 366 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  38.05 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.84 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  33.63 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  35.59 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3163  NmrA family protein  26.42 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  37.17 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  30.73 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  23.69 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  33.33 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1616  hypothetical protein  31.46 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.057231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  33.91 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  46.48 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5255  NmrA family protein  31.25 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>