32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06780 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL06780  expressed protein  100 
 
 		 386 aa  798    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.65729  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  26.26 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  24.65 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  22.41 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  23.88 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  23.5 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  22.04 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  27.17 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  30.51 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  21.39 
 
 		 326 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  29.32 
 
 		 290 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09531  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  23.17 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  30.28 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  26.92 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  26.61 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  27.36 
 
 		 273 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  27.36 
 
 		 273 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  24.11 
 
 		 293 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  28.32 
 
 		 288 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.87 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  26 
 
 		 340 aa  46.2  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  30.15 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.81 
 
 		 283 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  22.25 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  33.64 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  30.09 
 
 		 339 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  37.1 
 
 		 281 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 318 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>