247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3826 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3826  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
141 aa  275  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3259  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 
150 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101599  normal  0.0335337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.03 
 
 
150 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.82 
 
 
150 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  42.11 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.74 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.65 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.06 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.34 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  47.71 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  33.91 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.28 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.07 
 
 
146 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.85 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.1 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  39.58 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  39.1 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2219  alkylhydroperoxidase  40.46 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108098  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  42.74 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  39.1 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  39.06 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.37 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.24 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  45.37 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.37 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.18 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.59 
 
 
145 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.84 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  40.54 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.68 
 
 
152 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0882  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.24 
 
 
151 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0899  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
151 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0888  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
151 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.302466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.29 
 
 
146 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  38.24 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.74 
 
 
150 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  39.64 
 
 
157 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.96 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.71 
 
 
163 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.44 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.23 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  39.39 
 
 
157 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.48 
 
 
160 aa  87  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.3 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.41 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  39.71 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.5 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  37.01 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.41 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.88 
 
 
149 aa  84.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.55 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.39 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  39.68 
 
 
154 aa  84.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  38.58 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.16 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  40.18 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.76 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  41.74 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  36.72 
 
 
146 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.64 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.5 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  37.5 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  45.37 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.96 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.07 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  36.81 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.87 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  36.81 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.74 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  36.22 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  36.81 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.74 
 
 
163 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  33.91 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  36.22 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.71 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  35.04 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  36.7 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.5 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  39.83 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.62 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  34.62 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.57 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0825  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.65 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  35.97 
 
 
157 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.82 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.98 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>