296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1538 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  46.24 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  43.77 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  43.21 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  46.1 
 
 		 313 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  41.81 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  45.72 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  42.36 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  41.75 
 
 		 305 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  44.61 
 
 		 281 aa  210  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  41.75 
 
 		 350 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  41.67 
 
 		 303 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  41.34 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  43.01 
 
 		 281 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  44.52 
 
 		 296 aa  204  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  39.93 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  40.13 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  40.28 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  40.07 
 
 		 286 aa  202  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  39.1 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  40.6 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  40.42 
 
 		 289 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  38.91 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  38.91 
 
 		 322 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  41.64 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  38.97 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  38.97 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  38.97 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  43.98 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  41.3 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  41.22 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  37.72 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  39.72 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  45.93 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  45.28 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  43.46 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  38.58 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  40.94 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  43.54 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  39.91 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  38.87 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  39.62 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  45.83 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  39.52 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  39.33 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  35.31 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  45.79 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  41.82 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  42.28 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  44.96 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  43.8 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  41.22 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  43.8 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  43.26 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  43.8 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  41.08 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  37.8 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  38.89 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  42.25 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  36.74 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  43.85 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  36.84 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  40.09 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  41.43 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  44.67 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  35.45 
 
 		 309 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  42.98 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  38.71 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  40.28 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  41.4 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  39.84 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  37.31 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  45.87 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  39.83 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  43.15 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  35.37 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  42.39 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  44.81 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  40.95 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  42.15 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  42.15 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  43.78 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  36.73 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  38.76 
 
 		 268 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  43.17 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  41.74 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  39.65 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  39.91 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  42.11 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  36.93 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  40.68 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  41.1 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  39.33 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  33.2 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  40.08 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  39.04 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  37.08 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  39.26 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  38.03 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>