61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2117 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2117  proline hydroxylase-like protein  100 
 
 
126 aa  253  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04050  putative proline hydroxylase  100 
 
 
232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0403  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  93.9 
 
 
209 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5296  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  67.07 
 
 
244 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48380  2OG-Fe(II) oxygenase family  66.67 
 
 
210 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.583305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4854  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  68.49 
 
 
233 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5391  2OG-Fe(II) oxygenase  70.59 
 
 
210 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.020838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4235  2OG-Fe(II) oxygenase  64.38 
 
 
245 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  41.18 
 
 
212 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2102  cyclohexanone monooxygenase  90 
 
 
517 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200217  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0306  2OG-Fe(II) oxygenase  61.76 
 
 
213 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0982951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5159  2OG-Fe(II) oxygenase  60.29 
 
 
207 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5066  2OG-Fe(II) oxygenase  60.29 
 
 
211 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5212  2OG-Fe(II) oxygenase  58.82 
 
 
211 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4910  2OG-Fe(II) oxygenase  51.9 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  52.11 
 
 
219 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0970  proline hydroxylase  43.84 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00650089  normal  0.084866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02845  Oxidoreductase  47.37 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0289  SM-20-related protein  43.24 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.348615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2643  2OG-Fe(II) oxygenase  45.12 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  40.74 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01768  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein  44 
 
 
223 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0242801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  42.31 
 
 
214 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4923  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  36.9 
 
 
227 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  39.51 
 
 
211 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.306008 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1461  SM-20 domain-containing protein  39.71 
 
 
207 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.348442  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1614  2OG-Fe(II) oxygenase  41.56 
 
 
209 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0452187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3757  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  40.24 
 
 
225 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0458  hypothetical protein  40.24 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0434  hypothetical protein  40.24 
 
 
212 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3085  2OG-Fe(II) oxygenase  41.33 
 
 
210 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.850505  normal  0.241657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  42.47 
 
 
215 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48235  predicted protein  34.07 
 
 
326 aa  60.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652945  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3690  2OG-Fe(II) oxygenase  39.24 
 
 
217 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003576  SM-20-related protein  37.84 
 
 
197 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  42.31 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02535  hypothetical protein  37.84 
 
 
200 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  40.85 
 
 
224 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46896  predicted protein  38.46 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38427  predicted protein  37.89 
 
 
291 aa  55.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1422  2OG-Fe(II) oxygenase  38.75 
 
 
230 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000140265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2536  2OG-Fe(II) oxygenase  40.51 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375682  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  37.33 
 
 
220 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  40.51 
 
 
251 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0562  oxygenase  39.44 
 
 
252 aa  52  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92186  predicted protein  39.13 
 
 
324 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2041  2OG-Fe(II) oxygenase  38.24 
 
 
207 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1631  2OG-Fe(II) oxygenase  36.49 
 
 
199 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3563  SM-20 domain-containing protein  36.62 
 
 
207 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0550  2OG-Fe(II) oxygenase  40.85 
 
 
252 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.337301  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0643  2OG-Fe(II) oxygenase  35.53 
 
 
304 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0712073  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26414  predicted protein  36 
 
 
262 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0496773  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89355  predicted protein  37.31 
 
 
338 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1526  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.8 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1587  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.8 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938971  normal  0.613545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1593  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  33.8 
 
 
207 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45723  predicted protein  30.77 
 
 
541 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2476  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.94 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.343248  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1849  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.94 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1802  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.94 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.344329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1810  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  31.94 
 
 
199 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>