More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0740 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  520  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  99.13 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  67.1 
 
 
234 aa  322  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  67.26 
 
 
234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  66.37 
 
 
231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  63.91 
 
 
232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  67.71 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  65.02 
 
 
232 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  61.88 
 
 
236 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3264  hypothetical protein  48.43 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0926373  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0364  transposase-like protein  46.9 
 
 
235 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.72516  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3592  protein of unknown function DUF1568  46.46 
 
 
235 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00165115  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3015  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3749  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2737  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3719  transposase  45.45 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2788  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3215  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3691  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1766  hypothetical protein  45.45 
 
 
237 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2789  hypothetical protein  46.02 
 
 
235 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603101  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3127  hypothetical protein  45.74 
 
 
261 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0304  hypothetical protein  45.26 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0329  hypothetical protein  44.59 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3498  hypothetical protein  44.59 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827202  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0320  hypothetical protein  44.59 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396962  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2706  hypothetical protein  44.59 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0803898  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0401  hypothetical protein  44.59 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0380  hypothetical protein  44.59 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2966  hypothetical protein  43.5 
 
 
241 aa  191  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3244  protein of unknown function DUF1568  42.6 
 
 
241 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2897  protein of unknown function DUF1568  42.15 
 
 
250 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  45.98 
 
 
237 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  41.3 
 
 
232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  41.52 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  44.23 
 
 
216 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  40.79 
 
 
230 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  39.91 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  39.73 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3670  transposase and inactivated derivatives  38.39 
 
 
228 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  40.27 
 
 
234 aa  169  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3104  hypothetical protein  39.39 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0859  protein of unknown function DUF1568  41.2 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  0.123586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  39.46 
 
 
236 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5648  hypothetical protein  41.97 
 
 
226 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299518  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  37.44 
 
 
230 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  38.33 
 
 
230 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  38.33 
 
 
230 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  37.25 
 
 
231 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  37.96 
 
 
230 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  36.64 
 
 
235 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  36.61 
 
 
221 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  36.96 
 
 
235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  32.75 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  37.61 
 
 
222 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  28.7 
 
 
461 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  29.78 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  40.76 
 
 
174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  41.29 
 
 
165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  32.85 
 
 
312 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  34.12 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  30.43 
 
 
241 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  34.47 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  31.48 
 
 
221 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  32.88 
 
 
318 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  29.81 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  32.42 
 
 
322 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  30.92 
 
 
316 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  29.95 
 
 
323 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  31.65 
 
 
287 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  32.58 
 
 
313 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  30.99 
 
 
289 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  30.26 
 
 
316 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
304 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  36.25 
 
 
241 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  33.5 
 
 
316 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  35.21 
 
 
312 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  32.14 
 
 
226 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  35.92 
 
 
314 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  39.04 
 
 
251 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  29.81 
 
 
287 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  32.64 
 
 
223 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  29.58 
 
 
289 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  37.96 
 
 
288 aa  99.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  32.2 
 
 
325 aa  99.4  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  37.96 
 
 
288 aa  99  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  31.84 
 
 
335 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  33.84 
 
 
323 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  37.23 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  31.97 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  31.97 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  35.82 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  30.88 
 
 
320 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  39.61 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  30.56 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  34.88 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  31.47 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  34.59 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  31.43 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>