More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0215 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
294 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  41.6 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  39.93 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  37.02 
 
 
292 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  42.21 
 
 
292 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  41.95 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  39.84 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  39.7 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  41.37 
 
 
292 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  42.48 
 
 
274 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 
289 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 
291 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  39.36 
 
 
294 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  40.08 
 
 
292 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  34.67 
 
 
414 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  40.39 
 
 
289 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  38.73 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  36.98 
 
 
274 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  36.6 
 
 
274 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.6 
 
 
275 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  37.6 
 
 
275 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  37.6 
 
 
275 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  38.02 
 
 
274 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 
282 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 
275 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  36.33 
 
 
278 aa  166  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  37.1 
 
 
280 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  40.46 
 
 
278 aa  165  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  41.83 
 
 
278 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  36.1 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  38.95 
 
 
291 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  35.48 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.29 
 
 
280 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 
285 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.71 
 
 
275 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  39.29 
 
 
285 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  39.29 
 
 
285 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 
276 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.4 
 
 
276 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  38.28 
 
 
280 aa  159  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 
271 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  37.6 
 
 
296 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  41.73 
 
 
316 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  37.5 
 
 
275 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  33.46 
 
 
278 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  36.5 
 
 
275 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  35.47 
 
 
273 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  37.75 
 
 
275 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.99 
 
 
276 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  38.72 
 
 
275 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  36 
 
 
277 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  33.8 
 
 
276 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  36.95 
 
 
289 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.89 
 
 
275 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  34.22 
 
 
279 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  36.98 
 
 
275 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  34.11 
 
 
277 aa  149  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  34.8 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  34.8 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  34.8 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  35.86 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  35.46 
 
 
277 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  34.8 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.4 
 
 
279 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  37.34 
 
 
267 aa  146  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  31.56 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  34.8 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  33.87 
 
 
277 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  37.22 
 
 
272 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  34.66 
 
 
277 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3625  MCP methyltransferase, CheR-type  37.04 
 
 
298 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0636111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0237  protein-glutamate O-methyltransferase  36.11 
 
 
307 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1444  MCP methyltransferase, CheR-type  35.41 
 
 
300 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  32.92 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4074  chemotaxis methyltransferase  37.2 
 
 
302 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0332  MCP methyltransferase, CheR-type  38.22 
 
 
302 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.284961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0281  MCP methyltransferase, CheR-type  36.05 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354754  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0300  MCP methyltransferase, CheR-type  36.4 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000961073  normal  0.256387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  30.66 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  31.84 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2710  protein-glutamate O-methyltransferase  35.8 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  30.6 
 
 
297 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0661  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 
271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  32.47 
 
 
275 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  34.59 
 
 
273 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0040  CheR methyltransferase, SAM binding domain protein  28.8 
 
 
283 aa  126  5e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  35.63 
 
 
269 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0614  MCP methyltransferase, CheR-type  28.46 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  31.3 
 
 
288 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  30.68 
 
 
309 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  31.78 
 
 
291 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  34.26 
 
 
301 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  35.66 
 
 
280 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2700  MCP methyltransferase, CheR-type  33.09 
 
 
288 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  33.86 
 
 
284 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  28.76 
 
 
275 aa  122  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>