56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0118 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 		 239 aa  454  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  35.42 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  37.05 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  35.54 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  35.46 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  34.45 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  38.31 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  34.84 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  36.18 
 
 		 293 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  37.62 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  34.87 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  31.53 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  30.1 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  32.64 
 
 		 272 aa  85.1  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  30.37 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  30.88 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  30.92 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  32.48 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  41.84 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  38.61 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  31.13 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  29.38 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  30.54 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  33.56 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  36.2 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  30.69 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  31.12 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  34.43 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  32.86 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  28.21 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  27.08 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  32.12 
 
 		 750 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  32.89 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  29.34 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  34.01 
 
 		 265 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  31.9 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  29.8 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  27.98 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.08 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  32.8 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  31.68 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  26.74 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  28.66 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  29.74 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  35.35 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  30.61 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  31.56 
 
 		 504 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4315  hypothetical protein  26.4 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.356947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  31.48 
 
 		 518 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  27.57 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  30.4 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1682  hypothetical protein  33.68 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  28.76 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4069  hypothetical protein  29.47 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282629  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  32.85 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  26.29 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>