More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2114 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 330 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  96.36 
 
 		 330 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  96.97 
 
 		 330 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  66.67 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  40.84 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  37.01 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  41.21 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  40.55 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  31.45 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  31.01 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  31.87 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  31.69 
 
 		 377 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.9 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  29.75 
 
 		 368 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.8 
 
 		 370 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  26.22 
 
 		 371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  28.53 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  26.89 
 
 		 369 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  25.36 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  25.36 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  24.16 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  27.87 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  26.24 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  25.63 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  25.34 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  25.14 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  24.79 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  24.67 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  35.84 
 
 		 389 aa  99  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  35.8 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  27.86 
 
 		 410 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  22.71 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  24.72 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  24.79 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  25.81 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  27.23 
 
 		 407 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  23.37 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  38.06 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  26.56 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  22.95 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  34.93 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  24.8 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  34.09 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  26.72 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  25.36 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  30.93 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.36 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  27.78 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  35.03 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  29.17 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  29.73 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  46.3 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.85 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  33 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  31.49 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3152  tRNA modification GTPase TrmE  33.33 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.85 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  29.32 
 
 		 427 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  33.08 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  37.08 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  30.48 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  30.18 
 
 		 529 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.28 
 
 		 463 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  51.92 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.3 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  34.66 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  50 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.8 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  26.26 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  25.49 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  46.3 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.69 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.72 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.38 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  30.63 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.28 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  31.76 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 433 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  33.07 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  25 
 
 		 461 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3213  tRNA modification GTPase TrmE  31.02 
 
 		 489 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  38.89 
 
 		 476 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  49.09 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  29.51 
 
 		 485 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3097  tRNA modification GTPase TrmE  30.56 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151562  normal  0.0117151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.49 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  25.26 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  29.51 
 
 		 485 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  29.51 
 
 		 485 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3179  tRNA modification GTPase TrmE  29.77 
 
 		 464 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0373252  hitchhiker  0.000409063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.36 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  38.2 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  28.23 
 
 		 509 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  41.51 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2547  tRNA modification GTPase TrmE  32.41 
 
 		 464 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461446  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  38.32 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.84 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  31.58 
 
 		 509 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>