More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1512 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 158 aa  318  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  63.8 
 
 		 161 aa  205  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  58.49 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  55.74 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  56.73 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  52.88 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  52.73 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  50.89 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  51.89 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  50.89 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  55.77 
 
 		 120 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  44.6 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  44.6 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  55.77 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  48 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  54.81 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  54.81 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  49.14 
 
 		 145 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  47.2 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  47.12 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  50.96 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  43.06 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  49.06 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  49.04 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  48.08 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  49.04 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  47.12 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  47.17 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  46.9 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  45.19 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  41.28 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  41.28 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  44.34 
 
 		 131 aa  99.8  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  40.57 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  40.57 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  40.57 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  40.95 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 109 aa  83.6  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  33.75 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  30.83 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  36.21 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  42.7 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  35.96 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  34 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  40.45 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  33.88 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  30.83 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  31.67 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0062  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.613129  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  38.2 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  35.25 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  38.82 
 
 		 95 aa  67  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 98 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  32.5 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  34.09 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  32.43 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  34.95 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0574  ribosomal protein S6  32.71 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  30.97 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  33.7 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  34.21 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>