271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0062 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0062  ribosomal protein S6  100 
 
 		 114 aa  236  6.999999999999999e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.613129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  30.56 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  33.65 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  29.52 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  31.3 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  29.63 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  29.63 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  32.04 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  31.07 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  30.28 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  29.52 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  32.18 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  29.67 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  30.1 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  27.62 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  25.29 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  32.32 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  31.43 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  31.73 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  28.57 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  27.17 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  30.84 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  30.56 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>