More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2820 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  58.27 
 
 
560 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  56.83 
 
 
573 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.79 
 
 
562 aa  689    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  58.04 
 
 
586 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  57.17 
 
 
564 aa  656    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.33 
 
 
590 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  61.61 
 
 
560 aa  698    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  57.85 
 
 
560 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  58.1 
 
 
560 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.98 
 
 
570 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  57.37 
 
 
560 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  57.77 
 
 
565 aa  677    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  58.36 
 
 
560 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  73.72 
 
 
571 aa  867    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.39 
 
 
550 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  69.6 
 
 
567 aa  810    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  58.27 
 
 
560 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  60.07 
 
 
569 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.5 
 
 
568 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  100 
 
 
581 aa  1183    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  58.85 
 
 
569 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  61.16 
 
 
569 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.19 
 
 
570 aa  786    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  66.02 
 
 
556 aa  733    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  93.98 
 
 
581 aa  1120    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.93 
 
 
592 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  55.94 
 
 
573 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  58.05 
 
 
569 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  55.42 
 
 
563 aa  628  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.77 
 
 
556 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.08 
 
 
591 aa  359  9e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  38.94 
 
 
586 aa  353  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  37.91 
 
 
540 aa  346  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  37.16 
 
 
541 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  36.08 
 
 
540 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  35.9 
 
 
540 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  38.57 
 
 
567 aa  323  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  36.84 
 
 
521 aa  323  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  35.9 
 
 
540 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  35.9 
 
 
540 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  35.94 
 
 
540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  35.9 
 
 
540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  36.55 
 
 
540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  35.9 
 
 
540 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  35.71 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  35.9 
 
 
540 aa  319  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.41 
 
 
589 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  37.06 
 
 
591 aa  318  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.51 
 
 
592 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  34.56 
 
 
542 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  36.41 
 
 
553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.54 
 
 
586 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  35.66 
 
 
551 aa  297  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  34.53 
 
 
519 aa  295  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.14 
 
 
603 aa  286  7e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  34.5 
 
 
643 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.95 
 
 
805 aa  283  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  34.8 
 
 
648 aa  278  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.61 
 
 
569 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 
510 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.95 
 
 
590 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.06 
 
 
793 aa  257  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  33.4 
 
 
513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  32.96 
 
 
513 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  32.96 
 
 
513 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  33.14 
 
 
492 aa  254  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 
516 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  32.98 
 
 
639 aa  252  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  31.88 
 
 
553 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  33.47 
 
 
513 aa  246  9e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  33.07 
 
 
521 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  31.2 
 
 
553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  32.45 
 
 
536 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  33.71 
 
 
512 aa  240  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  32.99 
 
 
542 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  32.92 
 
 
599 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.66 
 
 
586 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.15 
 
 
590 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  29.19 
 
 
590 aa  203  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  30.23 
 
 
615 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  26.51 
 
 
480 aa  193  9e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  28.79 
 
 
586 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  28.76 
 
 
633 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  30.15 
 
 
604 aa  188  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  27.8 
 
 
621 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.41 
 
 
544 aa  180  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  27.36 
 
 
552 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  27.5 
 
 
608 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  30.09 
 
 
605 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2758  Sulfite reductase (NADPH)  28.34 
 
 
571 aa  177  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.66 
 
 
552 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  30.95 
 
 
595 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  28.69 
 
 
548 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  28.3 
 
 
713 aa  173  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  29.93 
 
 
595 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  28.57 
 
 
553 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  28.6 
 
 
543 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.92 
 
 
757 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  26.87 
 
 
545 aa  170  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  28.21 
 
 
553 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>