125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0774 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
559 aa  1054    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  40.39 
 
 
516 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  40.91 
 
 
798 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  43.94 
 
 
872 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.04 
 
 
837 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  40.66 
 
 
784 aa  207  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  41.62 
 
 
859 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.43 
 
 
770 aa  190  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3266  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  42.13 
 
 
792 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.159842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.47 
 
 
806 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.33 
 
 
772 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  35.31 
 
 
656 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  40.1 
 
 
806 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  39.54 
 
 
790 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  39.37 
 
 
888 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  37.11 
 
 
819 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  40.75 
 
 
800 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2103  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.58 
 
 
812 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.858083  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  39.57 
 
 
781 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  33.65 
 
 
710 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  36.5 
 
 
514 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  38.69 
 
 
867 aa  142  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  37.13 
 
 
829 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  35.04 
 
 
821 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  38.42 
 
 
519 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12442  hypothetical protein  36.06 
 
 
514 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2210  ComEC/Rec2-related protein  44.32 
 
 
851 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  35.56 
 
 
489 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  37.98 
 
 
826 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  35.46 
 
 
502 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  32.56 
 
 
769 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  30.15 
 
 
792 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  30.92 
 
 
816 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.92 
 
 
778 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17410  ComEC/Rec2-related protein  34.68 
 
 
787 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  31.34 
 
 
474 aa  98.2  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.39 
 
 
786 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  30.3 
 
 
798 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  39.19 
 
 
268 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  39.19 
 
 
268 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  43.41 
 
 
711 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2802  ComEC/Rec2-related protein  34.42 
 
 
524 aa  93.6  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.544709  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  27.05 
 
 
748 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  27.71 
 
 
734 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.35 
 
 
757 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  27.05 
 
 
748 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3914  ComEC/Rec2-related protein  36.04 
 
 
488 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.475357  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.45 
 
 
818 aa  90.1  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.37 
 
 
791 aa  88.2  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.2 
 
 
795 aa  87  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  28.52 
 
 
733 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.33 
 
 
796 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  24.08 
 
 
795 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  30.42 
 
 
724 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.08 
 
 
752 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.36 
 
 
761 aa  80.9  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.57 
 
 
794 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  27.92 
 
 
546 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  33.89 
 
 
591 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  25.08 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  28.29 
 
 
694 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1646  ComEC/Rec2-related protein  26.77 
 
 
747 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.938304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.79 
 
 
773 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  30.24 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.82 
 
 
773 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  32.42 
 
 
611 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  28.76 
 
 
872 aa  75.5  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  26.09 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.24 
 
 
759 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.53 
 
 
780 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  30.35 
 
 
734 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1107  ComEC/Rec2-related protein  28.36 
 
 
755 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.79 
 
 
773 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  26.62 
 
 
494 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.16 
 
 
773 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.73 
 
 
734 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  29.36 
 
 
493 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  32.3 
 
 
503 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.14 
 
 
841 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.84 
 
 
809 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  25.59 
 
 
593 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.82 
 
 
773 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  22.47 
 
 
524 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  24.46 
 
 
773 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.33 
 
 
781 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.46 
 
 
772 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.46 
 
 
773 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.46 
 
 
772 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  24.41 
 
 
626 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  27.84 
 
 
879 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  30.3 
 
 
843 aa  59.3  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  24.76 
 
 
679 aa  58.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1497  ComEC/Rec2-related protein  29.1 
 
 
728 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.177997  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.46 
 
 
654 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  28.91 
 
 
689 aa  57.4  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.31 
 
 
814 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  24.64 
 
 
604 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2831  ComEC/Rec2-related protein  32.59 
 
 
523 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0669965  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0978  ComEC/Rec2-related protein  31.07 
 
 
722 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.134973 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  27.37 
 
 
671 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>