More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0449 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 
380 aa  776    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  73.75 
 
 
340 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  72.64 
 
 
342 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  72.41 
 
 
350 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  71.38 
 
 
351 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  71.38 
 
 
351 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  70.46 
 
 
340 aa  474  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.87 
 
 
360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1407  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.36 
 
 
384 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000685892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.57 
 
 
340 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.06 
 
 
359 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.17 
 
 
338 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1827  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.04 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.46 
 
 
362 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.77 
 
 
362 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.46 
 
 
358 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  68.5 
 
 
340 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.87 
 
 
340 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.94 
 
 
347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.58 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.24 
 
 
342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.02 
 
 
348 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.08 
 
 
351 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.03 
 
 
328 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.29 
 
 
349 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.18 
 
 
361 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.34 
 
 
370 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  58.63 
 
 
373 aa  424  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.94 
 
 
362 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.8 
 
 
349 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.38 
 
 
344 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.59 
 
 
363 aa  418  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1090  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.76 
 
 
370 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.86 
 
 
345 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.76 
 
 
349 aa  418  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.46 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1281  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.78 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.61 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0419  GDP-mannose 4,6-dehydratase Bme9  58.79 
 
 
356 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.17 
 
 
371 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.38 
 
 
371 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.41 
 
 
361 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.77 
 
 
367 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.65 
 
 
364 aa  413  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02910  GDP-D-mannose dehydratase  55.21 
 
 
372 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.37 
 
 
372 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  56.32 
 
 
370 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.52 
 
 
368 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.43 
 
 
373 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.59 
 
 
360 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.72 
 
 
348 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.13 
 
 
349 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  55.84 
 
 
374 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  58.72 
 
 
348 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.21 
 
 
356 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.53 
 
 
369 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.24 
 
 
362 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4199  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 
374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 
373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 
373 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  57.1 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3269  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.4 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1790  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.4 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5153  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.03 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000400711  normal  0.218522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.66 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3190  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.11 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41976  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 
372 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.06 
 
 
362 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2093  hypothetical protein  57.22 
 
 
372 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.57 
 
 
373 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.46 
 
 
361 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.57 
 
 
373 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.29 
 
 
353 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0432  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55 
 
 
382 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14441  gdpmannose 4,6-dehydratase  54.62 
 
 
364 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.61 
 
 
365 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.1 
 
 
354 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.47 
 
 
372 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.713411  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.57 
 
 
373 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1482  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 
373 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246967  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.77 
 
 
367 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0821  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.91 
 
 
372 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2623  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.67 
 
 
373 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.39 
 
 
375 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4001  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.76 
 
 
378 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.57 
 
 
373 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.878549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2346  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13991  gdpmannose 4,6-dehydratase  55.87 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.193432  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13681  gdpmannose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 
368 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.84 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.45 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0253  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.77 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.86 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.75 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.48 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>