More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0297 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  328  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  65.09 
 
 		 187 aa  208  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  61.54 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  62.57 
 
 		 174 aa  204  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  63.91 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 		 174 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  59.76 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  62.35 
 
 		 176 aa  197  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  57.4 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  61.63 
 
 		 173 aa  194  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  63.91 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  61.9 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  62.72 
 
 		 173 aa  191  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  57.47 
 
 		 175 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  59.3 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  58.68 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  57.56 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  62.89 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  55.81 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  55.81 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 		 181 aa  180  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  59.17 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  58.82 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  59.41 
 
 		 212 aa  177  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  55.62 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  55.36 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  56.36 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  50.3 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  60.14 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  53.53 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  52.35 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  59.42 
 
 		 196 aa  157  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  49.11 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  53.59 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  45.24 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  39.43 
 
 		 178 aa  119  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.66 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  46.53 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  48.12 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  44.81 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  41.32 
 
 		 166 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  40.79 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  46.04 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  44.29 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  38.24 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  41.43 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  43.24 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  43.08 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  43.08 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.82 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  38.27 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  40.88 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  39.44 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 174 aa  97.4  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 181 aa  97.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  38.27 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 205 aa  95.5  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>