More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0492 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0492  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2396  DNA repair protein  54.86 
 
 		 164 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2184  DNA repair protein RadC  54.86 
 
 		 164 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0946  DNA repair protein RadC  54.86 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0685  DNA repair protein RadC  54.86 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2861  DNA repair protein RadC  53.74 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3426  DNA repair protein RadC  54.86 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334518 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1182  DNA repair protein RadC  51.72 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1396  DNA repair protein RadC  51.39 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1254  DNA repair protein RadC  51.39 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2355  DNA repair protein RadC  51.39 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  unclonable  0.000000132381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3005  DNA repair protein RadC  52.74 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4181  DNA repair protein RadC  51.03 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0593458  normal  0.95657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 224 aa  147  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  52.67 
 
 		 169 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54860  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000637442  unclonable  3.01496e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3298  DNA repair protein RadC  47.37 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 224 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  48.59 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  53.12 
 
 		 244 aa  141  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2927  DNA repair protein RadC  48.28 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  48.59 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  47.24 
 
 		 238 aa  140  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  47.97 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  46.63 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  48.61 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  50.78 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36040  DNA repair protein RadC-like protein  49.65 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  51.09 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1273  DNA repair protein RadC  51.09 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  55.28 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  48.47 
 
 		 234 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1867  DNA repair protein RadC  51.09 
 
 		 168 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  50.78 
 
 		 224 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  51.52 
 
 		 237 aa  137  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  46.88 
 
 		 158 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2951  DNA repair protein, RadC family protein  47.92 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  53.17 
 
 		 224 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  50.78 
 
 		 224 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  43.31 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2347  DNA repair protein RadC  47.55 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00287634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  46.41 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  45.7 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  50.79 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1658  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00985169  normal  0.385856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31260  RadC-like protein  47.55 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145795  unclonable  2.34568e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1252  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4157  DNA repair protein RadC  52.46 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  57.38 
 
 		 222 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2855  DNA repair protein, RadC family  46.62 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1655  DNA repair protein RadC  46.62 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4896  RadC family DNA repair protein  46.62 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  53.54 
 
 		 237 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  47.33 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  44.97 
 
 		 305 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1125  DNA repair protein, RadC family  45.95 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1402  DNA repair protein, RadC family  46.62 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0957622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1772  DNA repair protein RadC  46.84 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0323381  normal  0.027226 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  50.37 
 
 		 224 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2246  RadC family DNA repair protein  46.62 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  51.59 
 
 		 242 aa  131  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4680  DNA repair protein, RadC family  45.95 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  51.59 
 
 		 242 aa  131  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4202  DNA repair protein RadC  45.77 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.21413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  47.66 
 
 		 224 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  42.31 
 
 		 224 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4804  RadC family DNA repair protein  45.27 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3209  RadC family DNA repair protein  45.27 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  52.5 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  50.79 
 
 		 226 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  47.29 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3410  RadC family DNA repair protein  45.27 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  50.79 
 
 		 235 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3350  RadC family DNA repair protein  44.59 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  50.79 
 
 		 226 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  49.59 
 
 		 226 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  43.31 
 
 		 225 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1062  RadC family DNA repair protein  45.27 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 224 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2357  DNA repair protein RadC  46.85 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.162482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  47.52 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  46.83 
 
 		 224 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  47.41 
 
 		 224 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1455  RadC family DNA repair protein  44.81 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  43.92 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  48.44 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  47.66 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2409  DNA repair protein RadC  47.2 
 
 		 227 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  47.2 
 
 		 227 aa  124  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  46.03 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0625  DNA repair protein RadC  46.72 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  48.41 
 
 		 224 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0695  DNA repair protein RadC  54.92 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.63774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  45.67 
 
 		 221 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  43.62 
 
 		 257 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  45.67 
 
 		 221 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 222 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  45.67 
 
 		 221 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1257  DNA repair protein RadC  44.81 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>