More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1578 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  100 
 
 
466 aa  922    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  44.39 
 
 
448 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  44.35 
 
 
475 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  39.34 
 
 
491 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  38.43 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  39.18 
 
 
491 aa  319  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  39.18 
 
 
491 aa  319  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  39.18 
 
 
491 aa  319  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  39.18 
 
 
491 aa  319  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  39.18 
 
 
491 aa  319  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  39.18 
 
 
491 aa  318  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  38.51 
 
 
468 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  38.52 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  37.89 
 
 
477 aa  306  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  38.46 
 
 
442 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.22 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.63 
 
 
492 aa  303  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  35.82 
 
 
475 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  38.67 
 
 
467 aa  296  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  35.14 
 
 
485 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  37.64 
 
 
450 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.58 
 
 
468 aa  289  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  36.75 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  37.17 
 
 
474 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  39.82 
 
 
468 aa  283  6.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  36.36 
 
 
499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  37.02 
 
 
457 aa  272  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.26 
 
 
472 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  35.11 
 
 
497 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  36.12 
 
 
468 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  35.28 
 
 
448 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  34.93 
 
 
468 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  34.57 
 
 
480 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  35.21 
 
 
438 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  33.71 
 
 
464 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  34.09 
 
 
450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  34.39 
 
 
480 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  37.84 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  34.25 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  35.65 
 
 
449 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  37.61 
 
 
463 aa  253  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  35.27 
 
 
466 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  33.33 
 
 
480 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  34.33 
 
 
485 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.75 
 
 
482 aa  250  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  33.76 
 
 
437 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  34.48 
 
 
468 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  37.59 
 
 
475 aa  249  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  34.34 
 
 
464 aa  249  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  34.34 
 
 
464 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  33.64 
 
 
446 aa  249  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  34.34 
 
 
464 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  34.34 
 
 
464 aa  249  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  34.34 
 
 
464 aa  249  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  34.34 
 
 
464 aa  249  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  34.34 
 
 
464 aa  249  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  34.2 
 
 
464 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  34.2 
 
 
464 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  34.2 
 
 
464 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  34.2 
 
 
464 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  34.2 
 
 
464 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  34.34 
 
 
464 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  37.05 
 
 
447 aa  247  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  33.99 
 
 
486 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  34.13 
 
 
464 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  35.02 
 
 
486 aa  246  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  33.41 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  34.08 
 
 
533 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  35.45 
 
 
493 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  34.96 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  37.22 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  37.22 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  34.23 
 
 
480 aa  244  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  35.18 
 
 
476 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  34.35 
 
 
482 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  34.16 
 
 
504 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  33.55 
 
 
490 aa  242  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.81 
 
 
507 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  33.92 
 
 
480 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  34.04 
 
 
544 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.92 
 
 
473 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  34.44 
 
 
473 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  33.86 
 
 
459 aa  239  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  33.85 
 
 
465 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.14 
 
 
458 aa  239  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  34.93 
 
 
480 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  31.81 
 
 
441 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  35.71 
 
 
482 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  34.43 
 
 
491 aa  237  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  34.77 
 
 
478 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  32.81 
 
 
477 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  32.09 
 
 
480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  34.42 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  34.42 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  34.42 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  33.76 
 
 
496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  32.98 
 
 
479 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  31.42 
 
 
464 aa  232  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  35.22 
 
 
487 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  34.12 
 
 
490 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>