More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2494 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  100 
 
 		 398 aa  811    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  42.86 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  42.8 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  49.57 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  41.04 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  41.67 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  40.59 
 
 		 295 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  41.44 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  42.97 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  42.06 
 
 		 292 aa  199  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  47.78 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  40.64 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  41.7 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  40 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  41.35 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  38.72 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  40.57 
 
 		 291 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  41.35 
 
 		 310 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  41.35 
 
 		 310 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  38.62 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  38.62 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  37.8 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  40.93 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  40.54 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  34.76 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  41.09 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  40.54 
 
 		 311 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  39.85 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  39.15 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  40.17 
 
 		 283 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  35.74 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  36.78 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  36.44 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  34.88 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  37.31 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  35.29 
 
 		 283 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  38.28 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  38.28 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  34.17 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  36.15 
 
 		 282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  36.36 
 
 		 290 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  35.32 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  35.98 
 
 		 287 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  37.19 
 
 		 283 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  33.46 
 
 		 287 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  34.84 
 
 		 300 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  33.05 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  33.9 
 
 		 277 aa  126  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  33.19 
 
 		 499 aa  126  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  33.48 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  34.35 
 
 		 277 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  30.52 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  29.34 
 
 		 542 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  27.21 
 
 		 532 aa  83.2  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  32.14 
 
 		 548 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  29.8 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1145  putative malonate decarboxylase delta subunit  44.33 
 
 		 105 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.719808  normal  0.745191 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  29.49 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  30.96 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0153  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  26.5 
 
 		 570 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93983  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  28.51 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  31.25 
 
 		 538 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  29.18 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1767  malonate decarboxylase acyl carrier protein  40.38 
 
 		 110 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0891324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  29.53 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  27.34 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  27.34 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  30.4 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  31.89 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  29.06 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  30.67 
 
 		 556 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  30.67 
 
 		 556 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  30.67 
 
 		 556 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0532  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  26.27 
 
 		 292 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00109747  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1099  propionyl-CoA carboxylase  30.33 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  36.04 
 
 		 512 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4287  malonate decarboxylase subunit delta  38.61 
 
 		 105 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  31.94 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  27.82 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2895  malonate decarboxylase delta subunit  48.72 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.0309088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  29.07 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1080  malonate decarboxylase subunit delta  39.81 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  32.38 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  27.95 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5373  malonate decarboxylase acyl carrier protein  40.38 
 
 		 110 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00827947  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0537  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  27.03 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  30.71 
 
 		 512 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3307  propionyl-CoA carboxylase  32.02 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0078  malonate decarboxylase acyl carrier protein  39.22 
 
 		 112 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.343361 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0793  delta subunit of malonate decarboxylase  44 
 
 		 102 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0483637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2894  delta subunit of malonate decarboxylase  42.31 
 
 		 110 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.222092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  30.77 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5085  malonate decarboxylase subunit delta  40.82 
 
 		 101 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.241533  normal  0.113374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>