57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5373 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5373  malonate decarboxylase acyl carrier protein  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00827947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1767  malonate decarboxylase acyl carrier protein  76.36 
 
 		 110 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0891324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2894  delta subunit of malonate decarboxylase  80.91 
 
 		 110 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.222092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0078  malonate decarboxylase acyl carrier protein  72.82 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.343361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1844  malonate decarboxylase delta subunit  66.34 
 
 		 110 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.457888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1080  malonate decarboxylase subunit delta  61.32 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4019  malonate decarboxylase delta subunit  54.29 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1270  malonate decarboxylase subunit delta  49.02 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00245775  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1160  malonate decarboxylase subunit delta  49.02 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.965785  normal  0.221003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4413  malonate decarboxylase subunit delta  49.02 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.523505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1148  malonate decarboxylase subunit delta  49.02 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1242  malonate decarboxylase subunit delta  49.02 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549114  normal  0.0355903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2049  malonate decarboxylase subunit delta  48.04 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0789  malonate decarboxylase subunit delta  48.51 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.058655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0793  delta subunit of malonate decarboxylase  45.63 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0483637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1145  putative malonate decarboxylase delta subunit  41.58 
 
 		 105 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.719808  normal  0.745191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1323  malonate decarboxylase delta subunit  48.08 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0025  malonate decarboxylase subunit delta  50.53 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2802  malonate decarboxylase subunit delta  48.51 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02570  malonate decarboxylase subunit delta  48.45 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00238435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4941  malonate decarboxylase acyl carrier protein  45.45 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0738205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3865  malonate decarboxylase acyl carrier protein  45.45 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3036  malonate decarboxylase subunit delta  47.52 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0026  malonate decarboxylase subunit delta  50.53 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0540  malonate decarboxylase subunit delta  47.52 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1483  malonate decarboxylase subunit delta  47.52 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1453  malonate decarboxylase subunit delta  47.52 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0682344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0613  malonate decarboxylase subunit delta  47.52 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.763622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1257  malonate decarboxylase subunit delta  47.52 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.529343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1583  malonate decarboxylase subunit delta  47.52 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3191  malonate decarboxylase subunit delta  45.54 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.416357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5085  malonate decarboxylase subunit delta  53.75 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.241533  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3152  malonate decarboxylase subunit delta  49.47 
 
 		 102 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0294  malonate decarboxylase subunit delta  48.45 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1058  malonate decarboxylase delta subunit  45.54 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.453426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3297  malonate decarboxylase delta subunit  45 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0047  malonate decarboxylase subunit delta  48.42 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328223  normal  0.098952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0168  malonate decarboxylase subunit delta  48.42 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.381062  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0948  malonate decarboxylase subunit delta  44 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.798455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4287  malonate decarboxylase subunit delta  44.12 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4591  malonate decarboxylase subunit delta  44.21 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6856  malonate decarboxylase subunit delta  47.37 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2895  malonate decarboxylase delta subunit  53.09 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.0309088 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  40.38 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0444  malonate decarboxylase subunit delta  42.86 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5085  malonate decarboxylase, delta subunit  42.86 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1846  malonate decarboxylase subunit delta  49.4 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.431164  normal  0.0404894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10300  malonate decarboxylase subunit delta  41.84 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00121331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4927  malonate decarboxylase subunit delta  43.43 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2881  malonate decarboxylase subunit delta  39.8 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5300  malonate decarboxylase subunit delta  41.84 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185223  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4819  malonate decarboxylase subunit delta  48.19 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0030528  normal  0.0215828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2440  malonate decarboxylase subunit delta  38.78 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0411324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  38.55 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1245  malonate decarboxylase acyl carrier protein  32.91 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3777  malonate decarboxylase delta subunit  32.05 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0104183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2610  malonate decarboxylase acyl carrier protein  33.33 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.31883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>