More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2280 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  99.15 
 
 
234 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  38.77 
 
 
233 aa  171  7e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
246 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  39.17 
 
 
243 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  39.73 
 
 
244 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  37.39 
 
 
241 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.73 
 
 
246 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
244 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.87 
 
 
237 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  38.71 
 
 
246 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  36.7 
 
 
243 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  35.42 
 
 
239 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  34.68 
 
 
227 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.80305e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  37.27 
 
 
241 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.94 
 
 
243 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  32.89 
 
 
241 aa  140  2e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  36.87 
 
 
231 aa  139  4e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  37.9 
 
 
238 aa  138  8e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  36.07 
 
 
245 aa  136  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  37.76 
 
 
243 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  34.25 
 
 
296 aa  134  1e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  34.25 
 
 
230 aa  132  4e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  36.48 
 
 
233 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  34.68 
 
 
262 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.11 
 
 
228 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.65 
 
 
238 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
247 aa  128  8e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 
242 aa  128  9e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  34.08 
 
 
227 aa  127  1e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  34.31 
 
 
204 aa  127  1e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  34.23 
 
 
263 aa  127  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  34.23 
 
 
237 aa  127  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  32.57 
 
 
241 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  35.37 
 
 
233 aa  126  4e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  33.03 
 
 
241 aa  125  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  33.78 
 
 
230 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  36.61 
 
 
268 aa  125  8e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.04 
 
 
238 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.02342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  34.91 
 
 
232 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  35.91 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
247 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  31.39 
 
 
266 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
261 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  34.32 
 
 
245 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.43751e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  36.41 
 
 
240 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  41.34 
 
 
293 aa  120  1e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35.75 
 
 
247 aa  120  2e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  34.8 
 
 
227 aa  120  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  34.72 
 
 
240 aa  120  2e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.43 
 
 
233 aa  120  2e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.15929e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  34.8 
 
 
227 aa  120  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  34.8 
 
 
227 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  35.68 
 
 
274 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 
255 aa  118  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  33.91 
 
 
239 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
226 aa  117  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.61 
 
 
233 aa  117  1e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  1.70778e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  34.36 
 
 
227 aa  117  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  33.92 
 
 
227 aa  115  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  34.4 
 
 
255 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  32.24 
 
 
279 aa  114  1e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  33.02 
 
 
241 aa  113  2e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.98 
 
 
233 aa  114  2e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  34.82 
 
 
266 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 
233 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  33.48 
 
 
248 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  31.48 
 
 
245 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  36.53 
 
 
238 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
258 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  34.36 
 
 
227 aa  111  8e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  33.04 
 
 
227 aa  111  1e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  33.92 
 
 
227 aa  111  1e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  33.04 
 
 
227 aa  111  1e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  33.04 
 
 
227 aa  111  1e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  33.04 
 
 
227 aa  111  1e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  30.97 
 
 
231 aa  110  1e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  34.33 
 
 
286 aa  110  2e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
229 aa  110  2e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
245 aa  110  2e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  34.36 
 
 
227 aa  110  2e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
237 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.95242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  30.14 
 
 
242 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
258 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
222 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  32.6 
 
 
227 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  33.92 
 
 
227 aa  108  7e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.67 
 
 
251 aa  108  9e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  34.51 
 
 
240 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  29.75 
 
 
255 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.7 
 
 
259 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
264 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.69 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28 
 
 
230 aa  106  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.51 
 
 
230 aa  106  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  28.93 
 
 
255 aa  105  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
239 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  33.48 
 
 
262 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
213 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
248 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>