More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2666 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  65.13 
 
 
665 aa  910  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  99.85 
 
 
665 aa  1373  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  100 
 
 
665 aa  1374  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  51.75 
 
 
655 aa  690  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  100 
 
 
665 aa  1374  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  49.39 
 
 
653 aa  631  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  46.96 
 
 
666 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  45.13 
 
 
666 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  45.13 
 
 
666 aa  576  1e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.97059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  44.98 
 
 
666 aa  575  1e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  45.13 
 
 
666 aa  577  1e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  45.02 
 
 
663 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  44.61 
 
 
663 aa  563  1e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  45.23 
 
 
652 aa  558  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  5.07235e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  46.06 
 
 
652 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  42.5 
 
 
658 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  42.35 
 
 
676 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 
740 aa  472  1e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 
715 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  40 
 
 
572 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  37.89 
 
 
700 aa  417  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.88 
 
 
656 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 
664 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 
726 aa  400  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  38.22 
 
 
650 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  37.64 
 
 
698 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  38.22 
 
 
650 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  38.37 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  38.07 
 
 
650 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  38.37 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  38.22 
 
 
650 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  38.22 
 
 
650 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  38.37 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  38.37 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  38.37 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 
663 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  37.19 
 
 
656 aa  392  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  38.45 
 
 
659 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  38.37 
 
 
641 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 
743 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 
713 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.92 
 
 
696 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  34.77 
 
 
696 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  36.38 
 
 
702 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  36.22 
 
 
732 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  34.18 
 
 
656 aa  363  5e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
698 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
698 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
698 aa  362  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  35.28 
 
 
695 aa  353  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  34.92 
 
 
680 aa  349  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 
714 aa  346  8e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 
804 aa  333  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.34979e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  32.1 
 
 
739 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
799 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
799 aa  314  3e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
799 aa  313  5e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  35.13 
 
 
681 aa  308  2e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.97 
 
 
653 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  32.25 
 
 
704 aa  291  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  32.81 
 
 
635 aa  285  2e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  31.83 
 
 
697 aa  283  7e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 
657 aa  274  4e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 
665 aa  274  5e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 
648 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  29.16 
 
 
702 aa  255  2e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.92 
 
 
696 aa  254  5e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  29.22 
 
 
698 aa  253  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  29.57 
 
 
696 aa  253  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  31.02 
 
 
640 aa  251  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
649 aa  245  2e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.09269e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 
661 aa  245  2e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 
649 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 
662 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 
653 aa  244  4e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 
662 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 
649 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 
662 aa  241  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 
680 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  30.31 
 
 
746 aa  234  4e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  30.31 
 
 
746 aa  234  4e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  30.31 
 
 
746 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  30.35 
 
 
746 aa  233  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  30.57 
 
 
746 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.04738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  30.57 
 
 
746 aa  233  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.36629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  30.17 
 
 
746 aa  232  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 
746 aa  232  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  30.17 
 
 
746 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  29.93 
 
 
751 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  29.93 
 
 
751 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  29.8 
 
 
751 aa  227  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  29.67 
 
 
751 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  29 
 
 
750 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  29.44 
 
 
751 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.65 
 
 
742 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  37.24 
 
 
330 aa  223  1e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  28.94 
 
 
759 aa  221  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  28.57 
 
 
742 aa  215  2e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  29.33 
 
 
766 aa  214  5e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 
650 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>