58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0024 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  50 
 
 		 100 aa  110  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  45.92 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 100 aa  90.1  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  38.75 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  41.24 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  45 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  39.06 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  39.06 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  39.06 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.14 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  32.47 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  32.47 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 119 aa  43.5  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  36 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  28.75 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>