More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1894 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 
729 aa  1437    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  42.03 
 
 
756 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  41.92 
 
 
744 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.68 
 
 
764 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  42.31 
 
 
760 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.98 
 
 
754 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.4 
 
 
753 aa  485  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  41.68 
 
 
759 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  41.13 
 
 
725 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.69 
 
 
723 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  41.28 
 
 
723 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  37.78 
 
 
729 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  38.32 
 
 
731 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  41.09 
 
 
670 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.51 
 
 
737 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
721 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  35.5 
 
 
741 aa  320  9e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.05 
 
 
696 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  34.06 
 
 
734 aa  313  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  29.39 
 
 
758 aa  310  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.87 
 
 
758 aa  306  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 
758 aa  298  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.39 
 
 
758 aa  294  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 
738 aa  291  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 
746 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.48 
 
 
656 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.93 
 
 
672 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 
794 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  32.16 
 
 
753 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.05 
 
 
657 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.27 
 
 
658 aa  260  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
752 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.03 
 
 
694 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  33.83 
 
 
650 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.12 
 
 
643 aa  245  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
607 aa  239  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.02 
 
 
656 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 
645 aa  223  9e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.17 
 
 
614 aa  221  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  30.79 
 
 
665 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
667 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.1 
 
 
641 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
696 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.18 
 
 
638 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
701 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  36.24 
 
 
499 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.34 
 
 
701 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.43 
 
 
761 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  37.23 
 
 
701 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  38.39 
 
 
903 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  36.88 
 
 
701 aa  177  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  36.11 
 
 
499 aa  177  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.86 
 
 
936 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.85 
 
 
611 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  37.6 
 
 
671 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  33.71 
 
 
708 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  28.38 
 
 
635 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.35 
 
 
652 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 
675 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 
724 aa  163  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.13 
 
 
703 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
864 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  25.76 
 
 
744 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 
861 aa  160  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.27 
 
 
483 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  35.27 
 
 
483 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  26.5 
 
 
632 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.55 
 
 
637 aa  157  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  40.27 
 
 
483 aa  157  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.51 
 
 
859 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 
654 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
699 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 
858 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
702 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.26 
 
 
597 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.33 
 
 
632 aa  153  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  35.63 
 
 
1207 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 
284 aa  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 
911 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.91 
 
 
678 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  24.66 
 
 
582 aa  150  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
671 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 
726 aa  150  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
735 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.85 
 
 
636 aa  149  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  38.91 
 
 
643 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.12 
 
 
528 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.08 
 
 
757 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  27.41 
 
 
643 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.35 
 
 
860 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  39.04 
 
 
593 aa  143  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  40.3 
 
 
431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  40.61 
 
 
441 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  39.15 
 
 
681 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  36.6 
 
 
526 aa  142  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  34.86 
 
 
713 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 
738 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  34.89 
 
 
465 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  36.1 
 
 
518 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.13 
 
 
648 aa  135  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>