More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1054 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
241 aa  188  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
272 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 
241 aa  185  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
251 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
246 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
270 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  42.8 
 
 
245 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
244 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
250 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
260 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
238 aa  161  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
247 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
237 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
239 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
263 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
233 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
257 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
250 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
246 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
246 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  40.33 
 
 
244 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
249 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.76 
 
 
240 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
229 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  37.13 
 
 
309 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
229 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
244 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
248 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
231 aa  131  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.1 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  39.22 
 
 
245 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
237 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
231 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
248 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  31.51 
 
 
236 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  31.51 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  31.51 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  35.54 
 
 
242 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.32 
 
 
246 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
278 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44630  predicted protein  30.91 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
236 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
256 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
236 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  33.05 
 
 
251 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
236 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  33.17 
 
 
263 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.77 
 
 
236 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
240 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
269 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.34 
 
 
246 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
251 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
257 aa  98.6  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3450  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.38 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07999  conserved hypothetical protein  34.58 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
261 aa  95.5  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
234 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.65 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.96 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  33.84 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.18 
 
 
250 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
261 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.18 
 
 
250 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.65 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  35.82 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.46 
 
 
257 aa  92.8  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>