More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4128 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  53.14 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 243 aa  188  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  33.49 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  98.6  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.98 
 
 		 221 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.98 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.98 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  31.47 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.84 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.84 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.84 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.84 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  33.03 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  28.43 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.13 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2902  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  28.82 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  27.69 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  26.67 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>