87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01426 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  93.17 
 
 
206 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1564  hypothetical protein  79.7 
 
 
233 aa  338  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3311  hypothetical protein  69.04 
 
 
211 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000439249  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2554  hypothetical protein  71.65 
 
 
199 aa  294  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2775  hypothetical protein  71.13 
 
 
199 aa  290  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  69.07 
 
 
199 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1489  hypothetical protein  70.62 
 
 
199 aa  289  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1390  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0691994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  287  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  287  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  287  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  287  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  287  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  287  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2517  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  286  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0323759  normal  0.485125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2572  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  286  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2560  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  286  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0453539  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2472  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  286  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0596343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2680  hypothetical protein  69.59 
 
 
199 aa  286  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0592641  normal  0.884596 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1365  metal dependent phosphohydrolase  68.56 
 
 
199 aa  286  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0524848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2667  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.623812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1557  hypothetical protein  70.68 
 
 
197 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1820  hypothetical protein  70.68 
 
 
197 aa  286  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1449  hypothetical protein  70.68 
 
 
197 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2584  hypothetical protein  68.56 
 
 
199 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  67.02 
 
 
195 aa  266  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  67.19 
 
 
199 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  62.83 
 
 
195 aa  250  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  62.3 
 
 
195 aa  250  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  244  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4522  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2236  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2135  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000415566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2249  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000105341  hitchhiker  0.0000000380351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2185  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0727923  hitchhiker  0.000447096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1696  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  241  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102528  decreased coverage  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1871  hypothetical protein  60.73 
 
 
195 aa  240  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2484  hypothetical protein  59.16 
 
 
195 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1934  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00115512  normal  0.0675072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2146  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137554  normal  0.0196393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2041  hypothetical protein  59.69 
 
 
195 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00953182  normal  0.0478039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  60.21 
 
 
195 aa  236  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1803  metal dependent phosphohydrolase  53.68 
 
 
196 aa  223  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0203013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2359  metal dependent phosphohydrolase  52.11 
 
 
205 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  45.88 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  46.63 
 
 
195 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0049  metal dependent phosphohydrolase  49.49 
 
 
205 aa  188  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1070  metal dependent phosphohydrolase  47.34 
 
 
202 aa  187  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3233  hypothetical protein  48.45 
 
 
197 aa  184  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0639804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0261  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1584  metal dependent phosphohydrolase  45.41 
 
 
202 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
205 aa  172  5e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2032  hypothetical protein  44.9 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2017  putative phosphohydrolase  58.82 
 
 
144 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01268  hypothetical protein  37.06 
 
 
217 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42865  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3739  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 
195 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2033  putative alpha helix protein  61.39 
 
 
108 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  35.32 
 
 
201 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0381  HD superfamily hydrolase-like protein  27.27 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0780  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.351982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0797  metal-dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0380  HD superfamily hydrolase  25 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.535161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0647  metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.493215  normal  0.274929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2952  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0199  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 
182 aa  52.4  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.225671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  25.47 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0083  HD superfamily hydrolase  29.1 
 
 
214 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142377  normal  0.689622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0188  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
201 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0799  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2979  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3021  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0425017  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0369  metal dependent phosphohydrolase  25.76 
 
 
157 aa  45.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0859  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
177 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000211179 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  28.46 
 
 
412 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  29.01 
 
 
398 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  32.2 
 
 
405 aa  44.3  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7944  metal dependent phosphohydrolase  29.85 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1504  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.788309  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1335  metal dependent phosphohydrolase  24.46 
 
 
184 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0664485  normal  0.289844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1607  metal-dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  29.27 
 
 
406 aa  42.4  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 
359 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  30.43 
 
 
411 aa  42  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  27.86 
 
 
396 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>