More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01105 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01105  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004319  membrane protein  82.2 
 
 		 195 aa  337  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  45.7 
 
 		 204 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  46.11 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  45.16 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  47.28 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  45.16 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  48.82 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  47.65 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  47.65 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  40.86 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2056  hypothetical protein  31.65 
 
 		 203 aa  88.2  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000098362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  30.34 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  31.29 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  30.13 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  24.71 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  31.75 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  24.71 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  29.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  27.1 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.52 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  29.76 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28.22 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.38 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  26.71 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  25.4 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  24.35 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  23.64 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.1 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2349  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.24 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.913999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  25.93 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  26.95 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.25 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  26.43 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  26.42 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  26.15 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  25.93 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  27.59 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  24.04 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  27.59 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  26.09 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  29.69 
 
 		 279 aa  65.1  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  26.23 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.44 
 
 		 457 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4802  transmembrane protein  25.93 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  28.87 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  28.78 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  26.51 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  26.83 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  26.83 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4069  SNARE associated Golgi protein  24.17 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00208186  hitchhiker  0.00137396 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.85 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  27.65 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  27.95 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4953  alkaline phosphatase like protein  24.6 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0282  DedA family protein  25.93 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  26.9 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  28.48 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  29.78 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5255  alkaline phosphatase like protein  25.31 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  25.69 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.1 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  27.89 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  27.59 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  27.16 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  28.08 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  23.68 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  25.25 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  28.46 
 
 		 259 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  23.68 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  23.68 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  29.45 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.21 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4407  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.33 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  23.65 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  28.37 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  26.67 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  25.5 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  23.68 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  23.68 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  25.83 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  29.09 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  23.68 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  27.48 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  25.6 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  25.6 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  23.68 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  25.6 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  26.81 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  26.4 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  25.68 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  28.08 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>