More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2490 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
279 aa  548  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.81 
 
 
285 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.47 
 
 
288 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.78 
 
 
285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3227  putative sugar ABC transporter, permease protein  56.25 
 
 
285 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0108394  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.56 
 
 
285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 
286 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52 
 
 
288 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.390535  normal  0.378627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.1 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
292 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
292 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152491  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
292 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
255 aa  185  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  37.13 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
275 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  36.76 
 
 
275 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.23 
 
 
298 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
280 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  37.23 
 
 
272 aa  175  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
284 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2225  putative sugar ABC transport system, permease component  34.44 
 
 
268 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279383  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
288 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
316 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3737  ABC transporter, permease protein  34.89 
 
 
266 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1740  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.56 
 
 
266 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.986821 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
273 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
282 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
286 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
265 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0908154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
277 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.619722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  37.04 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
276 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
269 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.489917  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.170215  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
271 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
266 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000739004  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780875  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
268 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
289 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
289 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
289 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
297 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3049  transmembrane ABC transporter protein  33.21 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0698875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
268 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
270 aa  161  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
267 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3632  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.82 
 
 
266 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
270 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
315 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
276 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
274 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2665  ABC sugar (glycerol) transporter, inner membrane subunit  31.41 
 
 
267 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  34.57 
 
 
277 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  35.07 
 
 
277 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2206  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.73 
 
 
273 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
277 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
277 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
275 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  34.33 
 
 
277 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
270 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
291 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
267 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.286919  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
269 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
284 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
291 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
274 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
276 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
266 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
276 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0964612  normal  0.170787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
283 aa  156  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
270 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00885853  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
283 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
267 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.998448  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
277 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  0.23922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0828687  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 
280 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
296 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
266 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000192828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
266 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926994  hitchhiker  0.00696056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
317 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
293 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4035  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
270 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
274 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.395793  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30 
 
 
297 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.46 
 
 
277 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
317 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
296 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
272 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0836514  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.81 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  0.65761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>