More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0716 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 
223 aa  452  1e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  53.4 
 
 
209 aa  225  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  52.68 
 
 
207 aa  224  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  221  5e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.23482e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  219  4e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.04823e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.44936e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.36863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.63463e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.72324e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.34057e-10  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.56275e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.90155e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 
207 aa  218  8e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.00585e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  51.22 
 
 
206 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.20704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  52.97 
 
 
207 aa  215  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  51.67 
 
 
222 aa  215  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  52.91 
 
 
221 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.17748e-06 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  49.02 
 
 
208 aa  211  6e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.18286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  49.01 
 
 
208 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.99505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  51.94 
 
 
223 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 
207 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.03712e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  48.51 
 
 
206 aa  207  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  46.57 
 
 
206 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.85593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  48.04 
 
 
205 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.72593e-05  unclonable  1.97161e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  51.47 
 
 
206 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  2.54915e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 
206 aa  201  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.05367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  47.32 
 
 
207 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.47375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  49.5 
 
 
207 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  9.811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  49.5 
 
 
207 aa  198  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.34967e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 
207 aa  196  2e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.66858e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  49.27 
 
 
207 aa  196  2e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
208 aa  195  5e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.79055e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  45.67 
 
 
209 aa  194  8e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  48.51 
 
 
207 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 
207 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  46.04 
 
 
207 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.35339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 
207 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  46.79 
 
 
221 aa  192  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.11144e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 
208 aa  189  4e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  44.88 
 
 
207 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  4.75036e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  53.63 
 
 
210 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  46.57 
 
 
207 aa  185  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  1.46284e-08 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  44.29 
 
 
223 aa  185  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.24266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  44.55 
 
 
207 aa  183  2e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  45.27 
 
 
204 aa  182  4e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  46.29 
 
 
235 aa  181  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  43.07 
 
 
207 aa  181  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  9.84788e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  46.29 
 
 
235 aa  181  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  8.03665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  45.27 
 
 
204 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 
207 aa  181  8e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  41.46 
 
 
208 aa  181  8e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  3.6372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  51.79 
 
 
207 aa  180  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  4.5126e-06  hitchhiker  1.48432e-09 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  41.75 
 
 
207 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  46.04 
 
 
208 aa  178  5e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.38717e-07  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  43.63 
 
 
208 aa  177  1e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.04234e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 
211 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 
211 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.2 
 
 
221 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  44.93 
 
 
209 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  45.81 
 
 
217 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  44.88 
 
 
210 aa  174  1e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  44.71 
 
 
210 aa  174  1e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 
210 aa  172  2e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08860  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 
200 aa  172  4e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00776029  normal  0.0237616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0838  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 
200 aa  172  4e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  47.15 
 
 
216 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  45.89 
 
 
234 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  47.32 
 
 
210 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 
210 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  44.12 
 
 
212 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 
210 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  45.1 
 
 
207 aa  167  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  4.03747e-05  hitchhiker  2.67396e-11 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  47.37 
 
 
221 aa  167  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  44.78 
 
 
219 aa  167  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  40.89 
 
 
205 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  40.95 
 
 
214 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  46.88 
 
 
217 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  48.88 
 
 
210 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  2.05733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  46.57 
 
 
216 aa  165  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5048  50S ribosomal protein L4  48.66 
 
 
218 aa  165  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5122  normal  0.277146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  46.23 
 
 
216 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 
207 aa  165  6e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  45.73 
 
 
214 aa  164  7e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  40.29 
 
 
207 aa  164  7e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  7.91532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1014  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 
219 aa  164  1e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1031  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 
219 aa  164  1e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  47.09 
 
 
220 aa  164  1e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1041  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 
219 aa  164  1e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  44.95 
 
 
247 aa  163  2e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0583  50S ribosomal protein L4  43.44 
 
 
245 aa  163  2e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  48.09 
 
 
228 aa  163  2e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  47.73 
 
 
210 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  43 
 
 
206 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.69 
 
 
207 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  3.92239e-05  decreased coverage  1.22182e-05 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  47.03 
 
 
211 aa  162  4e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10716  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 
223 aa  162  4e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.311364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  42.48 
 
 
232 aa  162  5e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  46.02 
 
 
210 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>