More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0965 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  99.82 
 
 
555 aa  1140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  9.65574e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
555 aa  1144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.85421e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  48.34 
 
 
815 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  51.36 
 
 
647 aa  498  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  39.45 
 
 
499 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  38 
 
 
593 aa  271  3e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  38.09 
 
 
595 aa  270  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  35.44 
 
 
515 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  35.89 
 
 
654 aa  254  2e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.49088e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  34.65 
 
 
545 aa  255  2e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  34.85 
 
 
541 aa  254  4e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  34.65 
 
 
541 aa  254  4e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  36.23 
 
 
583 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  35.45 
 
 
455 aa  244  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  31.83 
 
 
522 aa  241  3e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  34.47 
 
 
454 aa  236  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  5.18329e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  31.44 
 
 
509 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  31.11 
 
 
575 aa  235  2e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  33.96 
 
 
493 aa  227  5e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  30.51 
 
 
1115 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  31.88 
 
 
591 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  32.18 
 
 
562 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  52.04 
 
 
258 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  32.14 
 
 
577 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  30.14 
 
 
606 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  30.37 
 
 
1088 aa  210  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  30.37 
 
 
1088 aa  210  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  29.79 
 
 
1093 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  29.3 
 
 
1093 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  31.2 
 
 
562 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  30.21 
 
 
1088 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  30.57 
 
 
1116 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  29.6 
 
 
1114 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  30.78 
 
 
551 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  31.27 
 
 
1139 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  29.59 
 
 
1092 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  29.33 
 
 
1112 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  30.02 
 
 
1111 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  30.5 
 
 
682 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  29.98 
 
 
1116 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  30.57 
 
 
1121 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  30.43 
 
 
562 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  29.87 
 
 
554 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0568  alpha amylase catalytic region  32.05 
 
 
441 aa  205  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.489897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  30.06 
 
 
1113 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  30.95 
 
 
1130 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  30.24 
 
 
1123 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  29.9 
 
 
1101 aa  204  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  29.68 
 
 
554 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  29.42 
 
 
588 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  28.04 
 
 
1110 aa  203  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4274  alpha amylase catalytic region  28.97 
 
 
529 aa  202  1e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  31.38 
 
 
441 aa  202  1e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  28.42 
 
 
1061 aa  202  1e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  29.45 
 
 
548 aa  202  1e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  28.6 
 
 
1154 aa  202  1e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  29.65 
 
 
1138 aa  202  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  29.1 
 
 
1088 aa  202  2e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  29.75 
 
 
540 aa  201  2e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  29.12 
 
 
596 aa  202  2e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  29.12 
 
 
596 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  29.12 
 
 
596 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.08 
 
 
1137 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  30.08 
 
 
1137 aa  201  4e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  30.51 
 
 
544 aa  201  4e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  29.31 
 
 
1121 aa  200  4e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  30.08 
 
 
1137 aa  201  4e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  28.39 
 
 
1152 aa  201  4e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.39 
 
 
1136 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  28.86 
 
 
572 aa  200  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  28.88 
 
 
1108 aa  200  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  30.06 
 
 
574 aa  199  1e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  28.04 
 
 
564 aa  199  1e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  29.83 
 
 
601 aa  199  1e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  29.88 
 
 
1137 aa  199  1e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  28.03 
 
 
1102 aa  198  2e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  28.71 
 
 
1088 aa  198  2e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  28.03 
 
 
1102 aa  198  2e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  28.69 
 
 
1102 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  29.21 
 
 
572 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  30.16 
 
 
572 aa  197  4e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  30.16 
 
 
553 aa  197  4e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  29.35 
 
 
1137 aa  197  4e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  29.33 
 
 
556 aa  197  5e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  28.6 
 
 
1100 aa  197  5e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  29.14 
 
 
563 aa  197  5e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.18 
 
 
1085 aa  197  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  32.64 
 
 
553 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  29.16 
 
 
1104 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  28.43 
 
 
536 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  28.77 
 
 
1154 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  29.51 
 
 
551 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  29.67 
 
 
1108 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  31.21 
 
 
524 aa  194  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  30.03 
 
 
559 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  31.65 
 
 
554 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0214  alpha-glucosidase  28.84 
 
 
552 aa  194  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417345 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  29.63 
 
 
1131 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.63 
 
 
1131 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  27.5 
 
 
1121 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>