More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0044 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0044  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 442 aa  879    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.22 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.83 
 
 		 436 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  34.31 
 
 		 436 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.41 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.207758  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.48 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0050  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.22 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.44 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.61 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0773  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.05 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0838  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.58 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 		 457 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.56 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.22 
 
 		 435 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1493  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.88 
 
 		 445 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  32.89 
 
 		 446 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.61 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.17 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  30.46 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.07 
 
 		 446 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.08 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  30.26 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.9 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.07 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.01 
 
 		 442 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.75 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.56 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  24.72 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.68 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.6 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.37 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.59 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.16 
 
 		 425 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  29.65 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  30.51 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.52 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  30.03 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  29.53 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.9 
 
 		 446 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.21 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  37.65 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.67 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  37.04 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.34 
 
 		 479 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.91 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.36 
 
 		 442 aa  93.6  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.29 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.86 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.44 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2130  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.93 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.37 
 
 		 462 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.54 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.31 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.79 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.74 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 		 463 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.2 
 
 		 462 aa  89.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2178  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.88 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.09 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  27.59 
 
 		 432 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.14 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06836  peptidase  29.78 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.84 
 
 		 462 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  32.08 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  30.26 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  24.07 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  32.08 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0569  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.46 
 
 		 447 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.289965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.84 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  27.83 
 
 		 455 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000861  predicted Zn-dependent protease  25.11 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  36.13 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.1 
 
 		 463 aa  86.7  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.48 
 
 		 435 aa  86.7  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.4 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  26.43 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  23.65 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.43 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.32 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  29.19 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.19 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  27.39 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  35.48 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.93 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.71 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.93 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.57 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1167  modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.975255  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1308  modulator of DNA gyrase  29.03 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5204  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.52 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000020169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  28.74 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.71 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.59 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.86 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>