143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3728 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0572  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  45.99 
 
 
228 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0584  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.99 
 
 
228 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0562  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.99 
 
 
228 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.08 
 
 
235 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0172  superoxide dismutase, copper/zinc binding  45.64 
 
 
236 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.509734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10437  periplasmic superoxide dismutase [Cu-Zn] sodC  44.96 
 
 
240 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0336347  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  41.7 
 
 
218 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  48.5 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  39.79 
 
 
210 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.36 
 
 
214 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  37.72 
 
 
226 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4195  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  38.65 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4261  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.65 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.871501  normal  0.596639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4422  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.65 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.342214  normal  0.255666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  39.46 
 
 
204 aa  95.1  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1989  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.31 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.62 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.43 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.97 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.29 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.14 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  35.68 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  33.9 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.18 
 
 
510 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.67 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.92 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  33.14 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.77 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  33.33 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.98 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.87 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  32.02 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  34.94 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.1 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  31.1 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.1 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.73 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.54 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.96 
 
 
171 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.64 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  34.29 
 
 
172 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.6 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  32.93 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.7 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  33.16 
 
 
173 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.03 
 
 
172 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  29.19 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.34 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  29.21 
 
 
185 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  31.49 
 
 
170 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  30.34 
 
 
178 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.14 
 
 
183 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.71 
 
 
174 aa  62.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  29.38 
 
 
194 aa  62.4  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.21 
 
 
185 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.34 
 
 
226 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  33.71 
 
 
172 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.52 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.91 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.53 
 
 
183 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.07 
 
 
169 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  33.33 
 
 
172 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  33.13 
 
 
178 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  32.73 
 
 
173 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  33.13 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  33.13 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  33.13 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  30.72 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  33.13 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  33.13 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  33.13 
 
 
173 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  31.79 
 
 
195 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  31.79 
 
 
189 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  32.53 
 
 
173 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.09 
 
 
175 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.22 
 
 
176 aa  58.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  31.79 
 
 
201 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  29.19 
 
 
180 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  31.79 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.17 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.92 
 
 
179 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.52 
 
 
173 aa  56.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  29.05 
 
 
172 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.52 
 
 
173 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.36 
 
 
179 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  32.53 
 
 
173 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.63 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.63 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.63 
 
 
181 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  32.53 
 
 
173 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  30.86 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  31.11 
 
 
158 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  32.53 
 
 
173 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  32.53 
 
 
173 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  32.53 
 
 
173 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.16 
 
 
176 aa  55.5  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.34 
 
 
178 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  28.14 
 
 
162 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.84 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>