129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0172 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0172  superoxide dismutase, copper/zinc binding  100 
 
 		 236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.509734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  83.83 
 
 		 235 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0572  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  76 
 
 		 228 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0584  superoxide dismutase, copper/zinc binding  76 
 
 		 228 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0562  superoxide dismutase, copper/zinc binding  76 
 
 		 228 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10437  periplasmic superoxide dismutase [Cu-Zn] sodC  65.22 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0336347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  46.47 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4195  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  50.3 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4261  superoxide dismutase, copper/zinc binding  50.3 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.871501  normal  0.596639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4422  superoxide dismutase, copper/zinc binding  50.3 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.342214  normal  0.255666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  42.13 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1989  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.26 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  44.31 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  42.86 
 
 		 204 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  44.22 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  43.53 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.82 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.63 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.42 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.53 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.91 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  33.71 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  32.58 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.95 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  31.18 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  35 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.87 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.98 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.39 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.55 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.3 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  30.18 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.21 
 
 		 510 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  29.19 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.06 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  30.06 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.06 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.38 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.22 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.82 
 
 		 169 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.32 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.43 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.94 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  33.09 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.38 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.27 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.02 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.85 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  28.32 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  35.81 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.38 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.85 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.85 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.85 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.32 
 
 		 165 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.85 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.85 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.88 
 
 		 182 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.84 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.84 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.79 
 
 		 179 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.43 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.19 
 
 		 173 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.94 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.92 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.19 
 
 		 173 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  26.49 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  32.12 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  25.37 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  33.09 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  31.82 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  31.82 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  31.82 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.3 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  29.69 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  36.96 
 
 		 180 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  29.69 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  30.97 
 
 		 189 aa  48.9  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  31.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.87 
 
 		 177 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.57 
 
 		 175 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  31.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  31.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  31.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  31.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  31.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  31.39 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.03 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  31.39 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.17 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  31.87 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  29.32 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.39 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.65 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  32.85 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  28.73 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.83 
 
 		 185 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  32.85 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  32.85 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  32.85 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>