126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10437 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10437  periplasmic superoxide dismutase [Cu-Zn] sodC  100 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0336347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0572  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  66.22 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0584  superoxide dismutase, copper/zinc binding  66.22 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0562  superoxide dismutase, copper/zinc binding  66.22 
 
 		 228 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0735  superoxide dismutase, copper/zinc binding  63.25 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0172  superoxide dismutase, copper/zinc binding  65.22 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.509734 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  44.96 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4195  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  48.8 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4261  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.8 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.871501  normal  0.596639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4422  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.8 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.342214  normal  0.255666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0664  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  38.53 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1989  superoxide dismutase, copper/zinc binding  44.97 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  44.12 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  43.45 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  42.57 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  42.24 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  45.67 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.61 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.15 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  31.75 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  34.73 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  36.76 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.18 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  35.25 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.34 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.98 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.09 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.51 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.65 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  32.65 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.65 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.53 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  30.34 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  33.58 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.01 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  26.67 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.63 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.63 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  30.41 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  27.61 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.76 
 
 		 173 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  35.92 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  30.11 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  28.4 
 
 		 510 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  32.95 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.36 
 
 		 169 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.94 
 
 		 174 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.39 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  28.3 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  33.57 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  33.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  33.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.17 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  33.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  33.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  33.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  33.57 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.49 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  33.57 
 
 		 173 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.93 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.65 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  30.77 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.41 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.21 
 
 		 172 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.46 
 
 		 162 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.35 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.11 
 
 		 179 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  29.31 
 
 		 182 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.33 
 
 		 171 aa  48.5  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  29.61 
 
 		 170 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.65 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  29.31 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.07 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  31.62 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  28 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  31.14 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  31.14 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  31.14 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.11 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  33.33 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.41 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.58 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  28.11 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.8 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  32.69 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  27.2 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  28.76 
 
 		 173 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  28 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  31.02 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  31.02 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  31.02 
 
 		 173 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  26.48 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.81 
 
 		 183 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  31.02 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  33.33 
 
 		 173 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>