More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1939 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 415 aa  815    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  64.01 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  62.94 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  61.68 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  67.36 
 
 		 410 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  61.98 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  60.1 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  55.61 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  64 
 
 		 409 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  60.05 
 
 		 411 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  60.38 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  60.38 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  60.65 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  58.99 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  55.73 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  60 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  58.9 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  57.77 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  54.87 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  64.43 
 
 		 266 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  62.86 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  44.29 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  56.65 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.1 
 
 		 238 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  57.08 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  42.73 
 
 		 613 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  40.08 
 
 		 574 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  40.26 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 		 237 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  37.44 
 
 		 238 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 		 239 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 		 238 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 238 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 256 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 273 aa  106  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  28.94 
 
 		 325 aa  99.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 261 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 256 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 272 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 276 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 238 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 245 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 236 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 314 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 289 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 		 243 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 267 aa  89.7  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 263 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.59 
 
 		 253 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 276 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.1 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  28.96 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.82 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  31.65 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.39 
 
 		 809 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.19 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.4 
 
 		 780 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.33 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  29.36 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.58 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  26.22 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.38 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.43 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  29 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 232 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 		 883 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.43 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 685 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  39.84 
 
 		 168 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  34.26 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.24 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>