More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0968 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  73.91 
 
 		 184 aa  280  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  73.91 
 
 		 184 aa  280  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  66.85 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  56.83 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 178 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  52.72 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  55.19 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  55.06 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  51.1 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  55.06 
 
 		 183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.37 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.37 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  52.2 
 
 		 178 aa  177  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  49.19 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  46.74 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 174 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 174 aa  174  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  48.91 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 176 aa  167  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  43.72 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  43.72 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  48.9 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  43.17 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  46.45 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  44.26 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  46.7 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  44.26 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  44.26 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  44.81 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3736  50S ribosomal protein L6  42.08 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000312741  decreased coverage  0.00108821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  46.15 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  45.6 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  47.25 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  45.6 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  44.26 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  45.95 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  46.15 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  43.17 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0420  50S ribosomal protein L6  42.08 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00669543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  42.62 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0338  50S ribosomal protein L6  43.17 
 
 		 177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000132809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  43.72 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  40.98 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>