More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2902 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  42.94 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  42.94 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  41.11 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  37.29 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  38.15 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  38.42 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  38.29 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  38.15 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  37.71 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  36.05 
 
 		 184 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  39.66 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  36.93 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  33.9 
 
 		 178 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  36.24 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  36.24 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  33.91 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.76 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  29.89 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  30.32 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  27.75 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  27.75 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  30.86 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  30.86 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  36.81 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.07 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  26.97 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  33.53 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  28.69 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  30.56 
 
 		 520 aa  57.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.93 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  27.78 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  30.84 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  32.65 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  23.23 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  30 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  37.5 
 
 		 568 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  29.9 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  29.41 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  31.58 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0761  CheW protein  31.48 
 
 		 475 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.951826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  32.63 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.42 
 
 		 444 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  32.41 
 
 		 298 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  31.61 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  35.29 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  23.49 
 
 		 466 aa  53.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  28.47 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  31.86 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  30.68 
 
 		 478 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.25 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.95 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.42 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.42 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.67 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  32.43 
 
 		 299 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  32.97 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  29.2 
 
 		 171 aa  52  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  31.96 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.69 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  34.69 
 
 		 300 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  23.24 
 
 		 166 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  25.83 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  28.8 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  30 
 
 		 518 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  38.36 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  30.63 
 
 		 299 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  31.96 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  30.63 
 
 		 299 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  23.89 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.03 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1485  CheW protein  28.57 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  31.63 
 
 		 317 aa  51.6  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  30 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.01 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  29.91 
 
 		 276 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  27.27 
 
 		 310 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  31.96 
 
 		 154 aa  51.2  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  28.03 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  26.76 
 
 		 309 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  27.27 
 
 		 309 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  33.33 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  29.05 
 
 		 531 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  26.76 
 
 		 309 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  30.33 
 
 		 314 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  30.53 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  23.39 
 
 		 344 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  23.08 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  32.26 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.84 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.19 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3197  purine-binding chemotaxis protein CheW, putative  23.7 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  30.61 
 
 		 314 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  30.61 
 
 		 314 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  30.61 
 
 		 314 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  23.78 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  29.67 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  30.61 
 
 		 314 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  30.61 
 
 		 314 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  29.73 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>