More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0987 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  100 
 
 		 107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  55.24 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  56.73 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  51.43 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  52.34 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  46.67 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  51.4 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3093  SMR family multidrug efflux pump  39.62 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3312  SMR family multidrug efflux pump  39.05 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.464243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3323  multidrug resistance protein, Smr family  39.62 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3107  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3353  SMR family multidrug efflux pump  40 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3353  small multidrug resistance protein  46.6 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3325  multidrug resistance protein, Smr family  40 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0708  multidrug resistance protein  48.04 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  51.58 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  48.6 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  52.63 
 
 		 110 aa  84.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  52.63 
 
 		 110 aa  84.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  53.33 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  40.38 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1102  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.12 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  44.12 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1476  SMR drug efflux transporter  43.93 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  49.07 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  50 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  47.57 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0062  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  45.1 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.766173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0313  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0296  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  38.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0300  multidrug-efflux transporter (multidrug resistance protein)  38.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0328  SMR family multidrug efflux pump  38.1 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  45.63 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0308  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0360  multidrug resistance protein, Smr family  37.14 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0172  small multidrug resistance protein  45 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0374  multidrug resistance protein, Smr family  38.1 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4946  multidrug resistance protein, Smr family  38.1 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0402  multidrug resistance protein, Smr family  37.14 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0151896  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0307  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1772  multidrug transporter EmrE  46.32 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.132035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1835  multidrug transporter EmrE  46.32 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1684  multidrug transporter EmrE  46.32 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.487331  normal  0.0413845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2946  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0357  SMR family multidrug efflux pump  36.45 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0601  small multidrug resistance protein  46.08 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.94236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1774  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  46.32 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  0.0937038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2512  small multidrug resistance protein  41.9 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  45.71 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1863  small multidrug resistance protein  33.64 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1501  multidrug transporter EmrE  45.26 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  45.26 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  44.66 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3074  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219411  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  42.72 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0807  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  47.71 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  45.87 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1177  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000160416  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1769  small multidrug resistance protein  38.83 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  38.83 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3077  small multidrug resistance protein  36 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  43.16 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  43.16 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1088  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4755  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.504307  normal  0.07446 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  43.75 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1719  small multidrug resistance protein  42 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241026 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  43.75 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0871  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  46.53 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  39.22 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  42.71 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  41.18 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  42.71 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2692  small multidrug resistance protein  46.43 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2328  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  41.67 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>