More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4518 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
272 aa  550  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
272 aa  550  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  40.75 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
248 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
252 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 
254 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  26.1 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  28.85 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  53.97 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  46.27 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  29.2 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  46.27 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 
246 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  38.28 
 
 
495 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  41.03 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  41.03 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  41.03 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  41.03 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  41.03 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
466 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 
466 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4432  regulatory protein GntR HTH  47.62 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0887  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3286  regulatory protein GntR HTH  49.21 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  48.39 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
466 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  46.75 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
466 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
466 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
466 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  39.29 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000225231  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  46.75 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  49.18 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  45.21 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  46.75 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4733  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  45.45 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4496  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4331  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 
127 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4343  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0525  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4847  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4728  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4717  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 
214 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.59 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  26.59 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  30.63 
 
 
468 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
237 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  24.61 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
466 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  44.44 
 
 
235 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
286 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  28.4 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
466 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
243 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  26.1 
 
 
238 aa  59.7  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
248 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 
241 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2750  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  40.79 
 
 
379 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0161564  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.21 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>