More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2303 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  100 
 
 
405 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  52.97 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  53.67 
 
 
428 aa  319  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  41.55 
 
 
447 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  40.39 
 
 
400 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  43.2 
 
 
410 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  41.81 
 
 
408 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
441 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  41.23 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  40.78 
 
 
423 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  39.75 
 
 
439 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  39.61 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  38.13 
 
 
392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.84 
 
 
406 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  52.78 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  37.43 
 
 
430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
394 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  40.11 
 
 
417 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  40.68 
 
 
399 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.37 
 
 
378 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.11 
 
 
397 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
392 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.07 
 
 
407 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
406 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
441 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  35.12 
 
 
430 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  37.3 
 
 
433 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  42.46 
 
 
478 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  36.71 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  43.49 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
445 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.88 
 
 
386 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
439 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.43 
 
 
443 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  45.56 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  48.85 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.46 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
405 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  38.07 
 
 
443 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  49.52 
 
 
408 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  37.98 
 
 
395 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  37.38 
 
 
372 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
496 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  37.47 
 
 
384 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  36.46 
 
 
438 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.53 
 
 
424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  38.84 
 
 
394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  38.62 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  35.44 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  47.14 
 
 
457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.58 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.4 
 
 
384 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.7 
 
 
421 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  40.26 
 
 
470 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  41.29 
 
 
291 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.58 
 
 
400 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  45.75 
 
 
369 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  44.13 
 
 
385 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.48 
 
 
414 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  36.52 
 
 
428 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
500 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
424 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  37.4 
 
 
372 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  37.13 
 
 
395 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.29 
 
 
402 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
421 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2450  histidine kinase  36.86 
 
 
432 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.516192  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.12 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  33.79 
 
 
413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.11 
 
 
357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  32.17 
 
 
384 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  37.69 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.35 
 
 
415 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.36 
 
 
372 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.71 
 
 
381 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  38.1 
 
 
399 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.25 
 
 
408 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
445 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
444 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.99 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  39.27 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  37.8 
 
 
462 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  36.72 
 
 
402 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.62 
 
 
380 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  32.97 
 
 
442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
467 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
382 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.92 
 
 
370 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
398 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  36.04 
 
 
390 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  36.97 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.18 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  39.92 
 
 
434 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  37.1 
 
 
407 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>