More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0776 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5444  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
260 aa  246  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.529641  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.96 
 
 
260 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0166508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
261 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3606  oxoacyl carrier protein reductase  50.78 
 
 
259 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117732  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.16 
 
 
273 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0078052  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
261 aa  228  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.863836  normal  0.150227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
259 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2917  putative reductase  48.45 
 
 
259 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
260 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730429  normal  0.182459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
268 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
254 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
252 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
252 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
257 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
256 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
254 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
248 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
276 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
257 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
251 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
270 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
282 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
255 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.71 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  37.35 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3977  putative 2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.76 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686311  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
250 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  32.67 
 
 
255 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
262 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
255 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
251 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
262 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  35.43 
 
 
264 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
270 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
262 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
269 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
258 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  35.2 
 
 
257 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
249 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
255 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  33.86 
 
 
254 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
256 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  35.48 
 
 
254 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  32.39 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
274 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
278 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
253 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  35.08 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  35.08 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
270 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
269 aa  138  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
249 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
255 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  34.68 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  34.68 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  34.68 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  31.58 
 
 
247 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
255 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
257 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
255 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  34.68 
 
 
254 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
263 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
260 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
269 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
262 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
256 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
251 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
255 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
285 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.92 
 
 
245 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  32.27 
 
 
263 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
285 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  34.8 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
255 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>