More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0006 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  51.76 
 
 
658 aa  644  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  51.54 
 
 
627 aa  636  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  65.02 
 
 
714 aa  884  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  57.19 
 
 
641 aa  731  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  53.69 
 
 
645 aa  677  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  52.38 
 
 
649 aa  645  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  53.8 
 
 
647 aa  700  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  55.31 
 
 
640 aa  665  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.96 
 
 
636 aa  675  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.63706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  56.13 
 
 
648 aa  716  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  55.31 
 
 
640 aa  665  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  66.16 
 
 
686 aa  815  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  56.53 
 
 
648 aa  709  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00060  DNA gyrase subunit B  63.1 
 
 
701 aa  804  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  53.54 
 
 
653 aa  675  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  55.62 
 
 
645 aa  718  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  56.55 
 
 
633 aa  708  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00100  DNA gyrase subunit B  66.07 
 
 
711 aa  820  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1634  DNA gyrase, B subunit  49.03 
 
 
708 aa  685  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  5.82851e-06  hitchhiker  0.000898108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  56.55 
 
 
640 aa  694  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  67.02 
 
 
686 aa  918  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  56.86 
 
 
637 aa  691  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  53.94 
 
 
642 aa  672  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  56.64 
 
 
641 aa  718  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  51.42 
 
 
651 aa  657  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 
655 aa  658  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 
655 aa  641  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  49.77 
 
 
655 aa  646  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0005  DNA gyrase, B subunit  64.68 
 
 
685 aa  876  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  64.87 
 
 
675 aa  860  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  65.62 
 
 
675 aa  864  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  56.57 
 
 
649 aa  750  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.85 
 
 
656 aa  688  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  58.4 
 
 
640 aa  716  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  51.86 
 
 
646 aa  662  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  55.54 
 
 
635 aa  672  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0007  DNA gyrase, B subunit  68.82 
 
 
670 aa  866  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  72.49 
 
 
719 aa  914  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  66.52 
 
 
675 aa  868  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.11 
 
 
638 aa  694  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  59.01 
 
 
636 aa  702  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  50.61 
 
 
655 aa  637  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  65.62 
 
 
675 aa  864  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  62.76 
 
 
711 aa  779  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  70.66 
 
 
654 aa  922  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  57.16 
 
 
640 aa  701  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  56.72 
 
 
642 aa  712  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.32 
 
 
642 aa  716  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  53.31 
 
 
637 aa  703  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  56.97 
 
 
645 aa  697  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  54.94 
 
 
650 aa  716  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  51.77 
 
 
649 aa  659  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.78 
 
 
644 aa  689  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  50.53 
 
 
647 aa  647  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  53.47 
 
 
644 aa  688  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  66.67 
 
 
695 aa  875  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.1906e-14 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  54.91 
 
 
645 aa  640  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  56.7 
 
 
640 aa  697  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  50.85 
 
 
634 aa  636  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  57.16 
 
 
640 aa  702  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  58.53 
 
 
644 aa  754  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  56.31 
 
 
635 aa  704  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  56.7 
 
 
640 aa  697  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 
650 aa  660  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  54.01 
 
 
636 aa  696  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 
665 aa  686  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  51.32 
 
 
651 aa  652  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  62.24 
 
 
696 aa  817  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  56.55 
 
 
640 aa  688  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  55.91 
 
 
647 aa  688  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.56 
 
 
642 aa  638  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  56.86 
 
 
642 aa  682  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  68.62 
 
 
661 aa  891  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  51.07 
 
 
658 aa  654  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  72.33 
 
 
648 aa  920  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  52.54 
 
 
659 aa  671  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  71.65 
 
 
652 aa  876  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  61.48 
 
 
633 aa  771  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  56.39 
 
 
635 aa  718  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  52.69 
 
 
643 aa  668  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  57.19 
 
 
640 aa  747  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  67.22 
 
 
685 aa  844  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  57.63 
 
 
640 aa  706  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  67.3 
 
 
720 aa  885  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  51.61 
 
 
651 aa  662  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  53.25 
 
 
652 aa  680  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  54.12 
 
 
636 aa  677  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  69.83 
 
 
657 aa  914  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  58.06 
 
 
637 aa  740  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  52.62 
 
 
643 aa  667  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0009  DNA gyrase, B subunit  63.52 
 
 
688 aa  844  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  55.64 
 
 
634 aa  704  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  3.28066e-10  unclonable  1.30354e-08 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  55.02 
 
 
650 aa  678  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  72.1 
 
 
679 aa  885  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.05 
 
 
675 aa  696  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  56.86 
 
 
640 aa  698  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  55.02 
 
 
637 aa  723  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.03 
 
 
632 aa  732  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0006  DNA gyrase, B subunit  79.97 
 
 
645 aa  1030  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0161215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  59.54 
 
 
644 aa  752  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>