More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0296 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.77 
 
 		 637 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  50.93 
 
 		 640 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 642 aa  1320    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 636 aa  642    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  51.16 
 
 		 650 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 634 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.56 
 
 		 640 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  51.09 
 
 		 633 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  50.7 
 
 		 633 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  50.7 
 
 		 644 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  55.03 
 
 		 640 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  49.39 
 
 		 636 aa  629  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  52.12 
 
 		 642 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  51.63 
 
 		 638 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  50.92 
 
 		 645 aa  627  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  48.53 
 
 		 637 aa  625  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  49.54 
 
 		 636 aa  627  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  48.52 
 
 		 628 aa  627  1e-178  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  51.39 
 
 		 635 aa  627  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  50.69 
 
 		 641 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  50.71 
 
 		 656 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  48.69 
 
 		 649 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  49.61 
 
 		 644 aa  624  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  48.53 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  49.76 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  50.62 
 
 		 632 aa  620  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  49.45 
 
 		 644 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  52.9 
 
 		 642 aa  618  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  49.77 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  49.3 
 
 		 635 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  51.46 
 
 		 638 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  51.61 
 
 		 638 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  48.84 
 
 		 642 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  51.39 
 
 		 636 aa  612  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 		 637 aa  612  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  48.56 
 
 		 649 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  48.06 
 
 		 642 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  48.85 
 
 		 648 aa  614  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  51.63 
 
 		 640 aa  608  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  47.1 
 
 		 686 aa  611  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  51.78 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  48.45 
 
 		 649 aa  611  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.46 
 
 		 643 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  51.01 
 
 		 640 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  47.31 
 
 		 642 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  48.9 
 
 		 654 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  50.85 
 
 		 640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  48.74 
 
 		 654 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  51.16 
 
 		 640 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  48.43 
 
 		 654 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  48.58 
 
 		 654 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.15 
 
 		 638 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  50.24 
 
 		 627 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  50.92 
 
 		 640 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  47.91 
 
 		 653 aa  601  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  48.18 
 
 		 647 aa  600  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  50.92 
 
 		 640 aa  598  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  50.08 
 
 		 633 aa  602  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0006  DNA gyrase, B subunit  47.67 
 
 		 681 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  48.63 
 
 		 654 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  48.22 
 
 		 683 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  51.01 
 
 		 640 aa  601  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  49.77 
 
 		 649 aa  595  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 		 652 aa  598  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  49.69 
 
 		 633 aa  597  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  47.12 
 
 		 695 aa  594  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  48.61 
 
 		 647 aa  592  1e-168  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  48.62 
 
 		 647 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  49.31 
 
 		 650 aa  593  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  47.28 
 
 		 696 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  47.84 
 
 		 644 aa  589  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 		 648 aa  590  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  46.64 
 
 		 637 aa  590  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  48.15 
 
 		 644 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  47.59 
 
 		 657 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  47.85 
 
 		 655 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  47.47 
 
 		 638 aa  585  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  46.44 
 
 		 636 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  48.14 
 
 		 651 aa  587  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0005  DNA gyrase, B subunit  50.78 
 
 		 655 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.452102  hitchhiker  2.3265900000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  46.76 
 
 		 643 aa  586  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  46.46 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  48.02 
 
 		 661 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  47.01 
 
 		 655 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  47.34 
 
 		 648 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  48.37 
 
 		 663 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  48.9 
 
 		 665 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  49.61 
 
 		 635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>