More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0629 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  100 
 
 		 102 aa  200  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  58.11 
 
 		 192 aa  100  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  56.96 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  53.75 
 
 		 287 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  54.93 
 
 		 273 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  46.08 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  46.23 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  48.15 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  45.57 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  40.19 
 
 		 206 aa  67  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  40.19 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  40.18 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  42.34 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  40.19 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  41.49 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  37.38 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  38.32 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  35.16 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.32 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  36.36 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  38.32 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  35.45 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  36.54 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 206 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  38.46 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  36.17 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.96 
 
 		 318 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  43.42 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  43 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  40 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  34.02 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  43.48 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  36.45 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  42.35 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  40.24 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  32.99 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  41.46 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  36.07 
 
 		 218 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  42.5 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  42.5 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  40.26 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  36.54 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  35.19 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  45.59 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  40.54 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  36.45 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  40.22 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  41.18 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  34.94 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  35.51 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  41.94 
 
 		 217 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  37.21 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  43.48 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  38.82 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 221 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  31.37 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  41.25 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  37.14 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  33.01 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  41.18 
 
 		 262 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  40 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>